119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4061 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4061  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 397 aa  817    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2840  filamentation induced by cAMP protein Fic  57.97 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0426  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.54 
 
 		 417 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.444251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0851  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.16 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0093  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.98 
 
 		 404 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0025  putative cAMP-induced filamentation protein  45.2 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.337972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2534  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.5 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2460  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.9 
 
 		 396 aa  288  9e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1372  fic family protein  41.04 
 
 		 388 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0445  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.95 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2298  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.05 
 
 		 413 aa  272  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266378  normal  0.174945 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4020  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.52 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142086  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1908  hypothetical protein  40.1 
 
 		 395 aa  270  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4217  hypothetical protein  40.26 
 
 		 400 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921636  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3358  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.41 
 
 		 413 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3790  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.82 
 
 		 402 aa  263  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4423  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.25 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.395598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1842  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.4 
 
 		 417 aa  240  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4624  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.34 
 
 		 397 aa  230  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0896  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.29 
 
 		 406 aa  219  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0861  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.79 
 
 		 400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4212  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.92 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0014  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.16 
 
 		 406 aa  200  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2568  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.75 
 
 		 410 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36540  Fic (filamentation induced by cAMP) protein  35.23 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4032  hypothetical protein  42.48 
 
 		 224 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0317  hypothetical protein  45 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0608446  normal  0.0902028 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.06 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3516  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.65 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.438285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.66 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  26.27 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  26.27 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.27 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.63 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.27 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.36 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.05 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.95 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.79 
 
 		 368 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.22 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.95 
 
 		 333 aa  53.9  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  27.17 
 
 		 328 aa  53.5  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2006  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.82 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0414865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.61 
 
 		 398 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.22 
 
 		 380 aa  52.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 380 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  34.57 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  34.57 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0160  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.59 
 
 		 245 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.132154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.35 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.35 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  25.97 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.2 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.2 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.68 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  28.82 
 
 		 377 aa  49.7  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.65 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.81 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0044  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.49 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.203132 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1335  Fic family protein  26.54 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.324562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.8 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.79 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.28 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.48 
 
 		 267 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.54 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  31.21 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  32.97 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.71 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  32.98 
 
 		 346 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.07 
 
 		 381 aa  46.6  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0201  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.42 
 
 		 488 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496594 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  28.14 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.71 
 
 		 309 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.55 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.23 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.31 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  23.56 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.14 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.5 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  36.21 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.54 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.03 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2264  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.16 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.03 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0664  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0557891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.21 
 
 		 509 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2238  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.15 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76756  decreased coverage  0.000875847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2696  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.53 
 
 		 253 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  27.08 
 
 		 502 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3396  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.25 
 
 		 222 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342322  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  26.47 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  26.47 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.47 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4175  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.15 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03140  hypothetical protein  30.97 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000000000117198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.43 
 
 		 511 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2737  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.77 
 
 		 251 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0264056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.09 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>