More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4028 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
299 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  97.99 
 
 
299 aa  603  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  76.25 
 
 
300 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  60.54 
 
 
297 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  60.62 
 
 
303 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  58.31 
 
 
297 aa  381  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  57.29 
 
 
298 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  39.24 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  34.59 
 
 
304 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  42.79 
 
 
297 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  31.14 
 
 
280 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 
284 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  34.33 
 
 
283 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 
283 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  32.09 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 
284 aa  142  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  32.17 
 
 
274 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  29.6 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  30.65 
 
 
289 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  30.48 
 
 
284 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
279 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 
282 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  31.33 
 
 
351 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  23.42 
 
 
289 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  31.7 
 
 
280 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  29.88 
 
 
287 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
284 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 
427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  31.33 
 
 
279 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  30.77 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  33.04 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28.75 
 
 
291 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 
291 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  32.51 
 
 
297 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  33.62 
 
 
280 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
455 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 
412 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  28.87 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  29 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 
425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  31.58 
 
 
718 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  31.14 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 
407 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  28.57 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  23.99 
 
 
305 aa  113  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  27.73 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  27.06 
 
 
408 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  31.69 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
292 aa  109  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
397 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  29.82 
 
 
292 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.39 
 
 
505 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
378 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  32.64 
 
 
288 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  28.17 
 
 
274 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
283 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  29 
 
 
297 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 
287 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  29.39 
 
 
730 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  30.91 
 
 
275 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  32.64 
 
 
288 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 
288 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.5 
 
 
340 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  30.14 
 
 
282 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  28.94 
 
 
724 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  26.18 
 
 
279 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  27.57 
 
 
293 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
285 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  28.37 
 
 
415 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  23.51 
 
 
290 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.5 
 
 
634 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  30.26 
 
 
716 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  28.68 
 
 
275 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  30.84 
 
 
292 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  27.54 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  30.49 
 
 
373 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25.3 
 
 
290 aa  99.4  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  24.15 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
406 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  27.72 
 
 
912 aa  96.3  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 
287 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  25.76 
 
 
280 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  27.32 
 
 
509 aa  96.3  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  24.89 
 
 
275 aa  95.9  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  28.92 
 
 
352 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  25.11 
 
 
272 aa  95.5  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  30.52 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  23.1 
 
 
353 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  27.43 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  27.39 
 
 
430 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  25.28 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 
440 aa  93.6  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  28.79 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>