More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7328 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  100 
 
 
348 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  76.22 
 
 
348 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  73.18 
 
 
310 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  71.62 
 
 
319 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  69.97 
 
 
310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  72.94 
 
 
309 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  69.31 
 
 
310 aa  438  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  67.85 
 
 
340 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
310 aa  425  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  66.98 
 
 
330 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  65.35 
 
 
346 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  70 
 
 
325 aa  421  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  66.45 
 
 
332 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  66.98 
 
 
344 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  64.86 
 
 
333 aa  414  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  68.32 
 
 
327 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  66.67 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  66.03 
 
 
353 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  61.85 
 
 
359 aa  408  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  62.3 
 
 
318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  64.26 
 
 
313 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  62.74 
 
 
318 aa  404  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  65.15 
 
 
333 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  61.76 
 
 
333 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  65.15 
 
 
333 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  65.15 
 
 
333 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  64.82 
 
 
331 aa  401  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  67.1 
 
 
325 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  63.46 
 
 
330 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  66.01 
 
 
317 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  63.52 
 
 
336 aa  391  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  66.45 
 
 
329 aa  391  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  66.03 
 
 
362 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  63.17 
 
 
361 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  65.4 
 
 
317 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  61.44 
 
 
331 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  60.66 
 
 
330 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  61.81 
 
 
334 aa  378  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  64.98 
 
 
327 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  61.71 
 
 
320 aa  377  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  60 
 
 
335 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  58.88 
 
 
311 aa  366  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  58.99 
 
 
325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  60.07 
 
 
319 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  59.28 
 
 
318 aa  361  8e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  56.72 
 
 
311 aa  359  4e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  59.33 
 
 
314 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  59.33 
 
 
314 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  57.24 
 
 
311 aa  352  5e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  56.31 
 
 
311 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  55.84 
 
 
311 aa  349  5e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  57.52 
 
 
313 aa  348  6e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  54.93 
 
 
311 aa  348  8e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  59 
 
 
314 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  55.97 
 
 
320 aa  342  5e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  55.23 
 
 
325 aa  340  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  55.16 
 
 
458 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  55.05 
 
 
311 aa  338  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  56.62 
 
 
332 aa  338  8e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  54.46 
 
 
361 aa  336  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1778  thioredoxin-disulfide reductase  52.12 
 
 
315 aa  334  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246241  decreased coverage  0.00675935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  52.58 
 
 
319 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  52.24 
 
 
456 aa  332  8e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  52.75 
 
 
460 aa  331  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  52.94 
 
 
453 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  52.94 
 
 
326 aa  330  3e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  55.38 
 
 
320 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  52.1 
 
 
461 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  52.98 
 
 
333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  52.1 
 
 
461 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  53.04 
 
 
324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  52.73 
 
 
323 aa  325  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  55.97 
 
 
320 aa  325  7e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  54.46 
 
 
315 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  51.5 
 
 
334 aa  323  3e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  51.44 
 
 
320 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  51.44 
 
 
320 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  49.03 
 
 
314 aa  322  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  53.25 
 
 
313 aa  322  7e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  51.84 
 
 
335 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  52.12 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  53.11 
 
 
317 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  53.11 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.8 
 
 
321 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30280  thioredoxin reductase 1  51.47 
 
 
316 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  56.67 
 
 
314 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0791  thioredoxin reductase  52.77 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2591  thioredoxin reductase 1  51.79 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0558  thioredoxin-disulfide reductase  54.1 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  52.4 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  52.13 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0703  thioredoxin reductase  52.77 
 
 
321 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  53.11 
 
 
325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  50 
 
 
331 aa  318  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  51.79 
 
 
314 aa  319  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
316 aa  318  9e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  53.44 
 
 
345 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  53.14 
 
 
324 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
316 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2959  thioredoxin reductase  53.38 
 
 
317 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.457436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>