49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7176 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  100 
 
 
238 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  37.61 
 
 
223 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  38.78 
 
 
228 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  32.77 
 
 
248 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  37.3 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  34.78 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  34.38 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  33.12 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  32.79 
 
 
212 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  32.79 
 
 
212 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  32.79 
 
 
212 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  34.68 
 
 
212 aa  63.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7172  hypothetical protein  31.11 
 
 
695 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
213 aa  62  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  32.06 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 
346 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  31.45 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  32.5 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  31.29 
 
 
352 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  32.26 
 
 
212 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  31.3 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  24.83 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  24.83 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  33.88 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  27.27 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  28.24 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
1204 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  22.44 
 
 
350 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  24.49 
 
 
343 aa  49.7  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  28.93 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1319  hypothetical protein  28.95 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.643261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  26.77 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  26.89 
 
 
225 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  26.89 
 
 
225 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  29.75 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.32 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  29.63 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  28.57 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.57 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
219 aa  42.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.81 
 
 
219 aa  42.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
219 aa  42.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>