More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6004 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  65.15 
 
 
211 aa  276  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.72 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.76 
 
 
210 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.58 
 
 
201 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.29 
 
 
222 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4014  acyl carrier protein phosphodiesterase  40.95 
 
 
218 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.09 
 
 
215 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0527579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.33 
 
 
207 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.91 
 
 
199 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.31 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.22 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.77 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.91 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  41.48 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.77 
 
 
199 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5486  (acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.94 
 
 
221 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125211  normal  0.0147175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.34 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.64 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.36 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1651  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.78 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.23 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  32.18 
 
 
210 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0234  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39 
 
 
210 aa  121  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0396895  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.36 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.93 
 
 
213 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.73 
 
 
206 aa  118  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5333  Acyl carrier protein phosphodiesterase-like protein  36.54 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.73 
 
 
201 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.73 
 
 
201 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.93 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.36 
 
 
233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.511283 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 
197 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.15 
 
 
201 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3545  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.09 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114749  normal  0.056833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.7 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.51 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.18 
 
 
204 aa  111  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4286  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.02 
 
 
210 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0135  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.35 
 
 
229 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  37.57 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  35.43 
 
 
208 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.64 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0140  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.35 
 
 
229 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.294363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  29.74 
 
 
202 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.98 
 
 
209 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.9 
 
 
207 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.25 
 
 
217 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.48 
 
 
202 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.52 
 
 
204 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.8 
 
 
201 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.05 
 
 
205 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  35.36 
 
 
202 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.67 
 
 
206 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  34.1 
 
 
203 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.39 
 
 
193 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.09 
 
 
204 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.63 
 
 
204 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  35.47 
 
 
203 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  35.84 
 
 
203 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  33.33 
 
 
202 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  35.47 
 
 
203 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.56 
 
 
214 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.56 
 
 
214 aa  101  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 
198 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.99 
 
 
198 aa  101  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.99 
 
 
198 aa  101  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.52 
 
 
198 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.9 
 
 
191 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  33.33 
 
 
206 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  34.29 
 
 
201 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 
232 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  33.33 
 
 
232 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  36.05 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  34.09 
 
 
199 aa  99  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.62 
 
 
222 aa  99  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.95 
 
 
198 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.42 
 
 
195 aa  98.6  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.11 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.68 
 
 
215 aa  98.6  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.11 
 
 
232 aa  98.2  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  28.42 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.42 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.77 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  34.68 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.03 
 
 
198 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  31.82 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.39 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.25 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.39 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.64 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.39 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.61 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  30.68 
 
 
201 aa  95.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  30.68 
 
 
201 aa  95.1  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>