More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5429 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_2711  AMP-dependent synthetase and ligase  68.8 
 
 		 539 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5429  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 525 aa  1040    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2696  AMP-dependent synthetase and ligase  68.8 
 
 		 539 aa  684    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2666  AMP-dependent synthetase and ligase  68.8 
 
 		 539 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2960  AMP-dependent synthetase and ligase  65.03 
 
 		 513 aa  662    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.958907  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3245  AMP-dependent synthetase and ligase  64.31 
 
 		 519 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0034073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4363  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1743  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1809  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.318036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1762  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.955756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1981  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 521 aa  229  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3702  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0183193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1761  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 500 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  29.17 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0355  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 559 aa  171  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476101  hitchhiker  0.000011609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  28.67 
 
 		 549 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0318  putative AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00246923  normal  0.308264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  25.72 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  28.47 
 
 		 552 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.49 
 
 		 514 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  27.87 
 
 		 560 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  28.49 
 
 		 552 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4364  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 566 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  28.37 
 
 		 549 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  27.34 
 
 		 549 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.5 
 
 		 828 aa  157  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  25.09 
 
 		 554 aa  156  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  27.34 
 
 		 549 aa  156  9e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  27.83 
 
 		 552 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  25.97 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  27.61 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  27.36 
 
 		 550 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2266  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 545 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 		 571 aa  153  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  27.89 
 
 		 550 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  29.52 
 
 		 540 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 525 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0867  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 		 543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  28.6 
 
 		 539 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 1043 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 520 aa  147  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  25.24 
 
 		 566 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  27.75 
 
 		 544 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  26.91 
 
 		 549 aa  147  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  28.04 
 
 		 549 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  29.23 
 
 		 540 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  29.23 
 
 		 540 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 524 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 		 630 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  25.44 
 
 		 579 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4634  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 557 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  27.42 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 510 aa  145  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 563 aa  145  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 		 557 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  26.75 
 
 		 547 aa  144  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  27.82 
 
 		 548 aa  144  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 		 582 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  28.12 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  30.07 
 
 		 576 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2746  putative long chain fatty acid CoA ligase  27.83 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  25.87 
 
 		 566 aa  141  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  25.18 
 
 		 518 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  27.71 
 
 		 576 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.04 
 
 		 510 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.3 
 
 		 526 aa  140  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  26.09 
 
 		 574 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.85 
 
 		 512 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  26.7 
 
 		 843 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  26.36 
 
 		 570 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 590 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1027  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0505944  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  26.8 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  26.87 
 
 		 573 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  28.16 
 
 		 571 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 512 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 544 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  27.55 
 
 		 570 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  26.68 
 
 		 521 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 		 551 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0324  putative AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 581 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 591 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  25.73 
 
 		 496 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  25.38 
 
 		 490 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  26.39 
 
 		 527 aa  137  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 558 aa  137  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0674  putative fatty-acid--CoA ligase  26.39 
 
 		 533 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.11643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  27.11 
 
 		 538 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  26.63 
 
 		 576 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  28.93 
 
 		 575 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  25.78 
 
 		 577 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>