More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4449 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  100 
 
 
398 aa  814    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  42.89 
 
 
402 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  42.53 
 
 
401 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  37.37 
 
 
410 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  37.29 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  36.22 
 
 
399 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  35.09 
 
 
410 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  35.24 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  34.74 
 
 
402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  37.02 
 
 
392 aa  216  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  36.02 
 
 
423 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  35.34 
 
 
429 aa  213  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  34.16 
 
 
414 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  35.82 
 
 
398 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.25 
 
 
411 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  33.24 
 
 
402 aa  209  9e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  33.83 
 
 
436 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  34.03 
 
 
415 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  33.24 
 
 
402 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  37.22 
 
 
411 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34.51 
 
 
412 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  33.84 
 
 
412 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  34.01 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  33.6 
 
 
398 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  33.58 
 
 
408 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  34.41 
 
 
405 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  38.64 
 
 
414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  36.87 
 
 
407 aa  199  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.79 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  33.6 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  31.42 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.6 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.96 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  33 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  32.22 
 
 
421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  33.08 
 
 
407 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  33.08 
 
 
407 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  33.08 
 
 
407 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.28 
 
 
411 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  34.29 
 
 
402 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  34.75 
 
 
405 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.07 
 
 
411 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  29.87 
 
 
422 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.77 
 
 
410 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.8 
 
 
411 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.17 
 
 
412 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.8 
 
 
411 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.8 
 
 
411 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  32.7 
 
 
400 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  34.99 
 
 
427 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.55 
 
 
411 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.01 
 
 
411 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  32.96 
 
 
417 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.53 
 
 
411 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32630  cytochrome P450  35.15 
 
 
444 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301042  hitchhiker  0.00539785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  33.77 
 
 
407 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.69 
 
 
417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  33.33 
 
 
409 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  33.33 
 
 
409 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  32.16 
 
 
399 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  33.72 
 
 
430 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  32.41 
 
 
388 aa  187  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0542  cytochrome P450  31.58 
 
 
413 aa  186  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.353046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  35.7 
 
 
396 aa  186  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  33.52 
 
 
393 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0556  cytochrome P450 enzyme  31.58 
 
 
407 aa  186  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  32.84 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  33.71 
 
 
406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.21 
 
 
420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  31.64 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  31.73 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  33.33 
 
 
417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  36.19 
 
 
406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  33.24 
 
 
393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  33.17 
 
 
443 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  31.27 
 
 
429 aa  183  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  31.88 
 
 
413 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  31.58 
 
 
405 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  33.61 
 
 
400 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.6 
 
 
411 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  36.1 
 
 
398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  30.81 
 
 
406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  31.89 
 
 
396 aa  180  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  33.78 
 
 
395 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  32.79 
 
 
402 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  35.69 
 
 
421 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  34.58 
 
 
416 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  30.73 
 
 
408 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.96 
 
 
426 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  37.29 
 
 
423 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  30.96 
 
 
408 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.8 
 
 
398 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  33 
 
 
394 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  33.92 
 
 
417 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  33.97 
 
 
395 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  34.55 
 
 
420 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  32.5 
 
 
413 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  32.12 
 
 
409 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.89 
 
 
417 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  34.16 
 
 
417 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>