156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4256 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 406 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  45.76 
 
 		 344 aa  293  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  46.32 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  45.91 
 
 		 343 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  45.07 
 
 		 340 aa  285  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  45.33 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  43.96 
 
 		 348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  44.85 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  43 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  45.26 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  44.35 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  43.35 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  44.35 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  41.64 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0670  2OG-Fe(II) oxygenase  45.63 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  44.85 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  42.38 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  42.18 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  41.11 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  41.91 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  40.53 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3166  2OG-Fe(II) oxygenase  43.12 
 
 		 335 aa  242  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  42.2 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  40.95 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  41.29 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  41.29 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  40.86 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  40.05 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0530  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.82 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1214  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33.42 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.982444  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1333  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  33.16 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.73522  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  34.69 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10323  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14880)  34.61 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32280  Naringenin 3-dioxygenase  32.4 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271742  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  29.72 
 
 		 349 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1992  2OG-Fe(II) oxygenase  48.43 
 
 		 281 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  34.43 
 
 		 346 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02668  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00750)  30.56 
 
 		 353 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0894035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  32.11 
 
 		 339 aa  133  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  33.62 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  32.76 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  32.2 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  31.03 
 
 		 320 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  29.24 
 
 		 330 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  30.66 
 
 		 335 aa  126  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  31.42 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  31.42 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  31.42 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  30.72 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  29.73 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  28.49 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  28.57 
 
 		 318 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07893  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 		 326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  31.16 
 
 		 329 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.13 
 
 		 321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.3 
 
 		 321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45097  predicted protein  34.28 
 
 		 233 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  29.85 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  30.86 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.75 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.9 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  31.42 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  30.84 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  29.77 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  27.79 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  30.33 
 
 		 351 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  30.59 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  31.47 
 
 		 341 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  28.35 
 
 		 341 aa  99.8  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  32.13 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  27.93 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  28 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  28.4 
 
 		 321 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  29.2 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  26.32 
 
 		 318 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  30.25 
 
 		 348 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  27.95 
 
 		 311 aa  93.2  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  29.33 
 
 		 313 aa  93.2  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  29.51 
 
 		 323 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  26.51 
 
 		 316 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  28.71 
 
 		 323 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  27.38 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  26.81 
 
 		 318 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  26.76 
 
 		 316 aa  88.2  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  26.21 
 
 		 318 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44178  predicted protein  27 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  27.62 
 
 		 306 aa  86.7  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  29.21 
 
 		 309 aa  86.7  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  25.36 
 
 		 341 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  27.53 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  23.45 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  24.18 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  24.86 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  27.87 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  28.7 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  26.23 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34797  predicted protein  23.83 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.242371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  26.75 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2885  2OG-Fe(II) oxygenase  30.52 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>