More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0366 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 506 aa  1013    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  76.38 
 
 		 524 aa  789    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 466 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  48.24 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 474 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 470 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 469 aa  432  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 481 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 471 aa  415  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 465 aa  411  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 481 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 549 aa  389  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 487 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  39.4 
 
 		 588 aa  374  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 468 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 474 aa  364  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 481 aa  363  6e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 451 aa  362  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 470 aa  359  5e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 481 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 466 aa  356  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 486 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 465 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 456 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 479 aa  353  5e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 458 aa  353  5e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 465 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 485 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 477 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 456 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 465 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 493 aa  352  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 461 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 498 aa  351  2e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 465 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 		 472 aa  350  3e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 461 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 460 aa  349  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 460 aa  349  8e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 460 aa  349  8e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 459 aa  349  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 470 aa  348  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 490 aa  347  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 469 aa  346  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 459 aa  347  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 460 aa  346  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 488 aa  346  7e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 481 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 476 aa  343  5e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 501 aa  343  5e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 464 aa  343  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 466 aa  343  5e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 493 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 493 aa  343  5.999999999999999e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 460 aa  343  5.999999999999999e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 494 aa  342  7e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 474 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>