266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4458 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  100 
 
 		 333 aa  664    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  52.47 
 
 		 328 aa  309  5.9999999999999995e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  51.69 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  47.09 
 
 		 357 aa  248  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  44.48 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  42.39 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  42.39 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0674  adenosine deaminase  41.12 
 
 		 343 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0226748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  41.12 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0605  adenosine deaminase  40.53 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.624245  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0572  adenosine deaminase  40.24 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00357349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  40.59 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  40.54 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24030  adenosine deaminase  39.59 
 
 		 343 aa  195  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0670  adenosine deaminase  39.83 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000235929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3173  adenosine deaminase  40.24 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  44.18 
 
 		 368 aa  192  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29960  adenosine deaminase  38.69 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.540626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4085  adenosine deaminase  38.44 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3597  adenosine deaminase  41.33 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  32.94 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  34.31 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0534  adenosine deaminase  43.62 
 
 		 360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.125477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  35.28 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  34.78 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  32.65 
 
 		 346 aa  165  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  34.64 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  35.47 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  33.84 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  36.56 
 
 		 360 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  35.28 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  35.47 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  32.94 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  33.63 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4101  Adenosine deaminase  37.74 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  33.64 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  33.93 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  30.7 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  33.84 
 
 		 378 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  33.94 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  33.55 
 
 		 327 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  33.63 
 
 		 342 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  32.92 
 
 		 341 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  31.16 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  33.96 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3645  adenosine deaminase  34.32 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  27.38 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  32.59 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  35.38 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  32.25 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  33.55 
 
 		 324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  33.53 
 
 		 341 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  30.5 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  32.63 
 
 		 343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  30.57 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  31.92 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  27.08 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  30.15 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  33.54 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  32.72 
 
 		 353 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  32.51 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  35.21 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  32.14 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  33.23 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  29.43 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  32.49 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  28.1 
 
 		 335 aa  142  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  31.19 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  30.82 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  31.71 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  31.71 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  31.71 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  29.56 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  33.02 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  34.28 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  30.86 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  29.68 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  33.23 
 
 		 682 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  33.23 
 
 		 682 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  32.63 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  31.12 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  32.7 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3003  adenosine deaminase  32.73 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  29.56 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  29.97 
 
 		 338 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  32.39 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  32.39 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  33.04 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  28.71 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  31.13 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  31.45 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  29.29 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  34.43 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  33.55 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  32.82 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  32.39 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  30.3 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>