More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4363 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4363  putative integral membrane protein  100 
 
 		 231 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0242225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0218  SNARE associated Golgi protein  71.89 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4182  SNARE associated Golgi protein  48.91 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.989097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  41.98 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  37.06 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.66 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.46 
 
 		 201 aa  118  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.34 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.63 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  37.71 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  33.65 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  36.46 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  33.65 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  31.38 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  34.22 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  38.01 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  33.69 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  36.84 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  36.93 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  33.69 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  33.69 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  33.69 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.92 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  32.11 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  33.33 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.33 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  38.58 
 
 		 363 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  33.16 
 
 		 220 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  34.22 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  36.74 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.46 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  40.89 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38320  uncharacterized membrane-associated protein  36.26 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  31.44 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  33.69 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  32.62 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  39.49 
 
 		 198 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  32.62 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  38.86 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  35.48 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  33.33 
 
 		 252 aa  104  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  35.2 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  39.8 
 
 		 242 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  39.8 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  39.8 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  37.75 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  39.8 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  39.8 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  39.8 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  37.8 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  33.69 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  34.15 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  32.7 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  39.8 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.08 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  34.92 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  32.97 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  32.26 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  32.26 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  32.99 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  35.45 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  34.18 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  34.09 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  32.57 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0676  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.2 
 
 		 206 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.285767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  36.84 
 
 		 212 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  35.29 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  38.38 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  32.8 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  31.72 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  35.63 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  36.18 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  32.82 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  34.92 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  31.75 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.57 
 
 		 458 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  37.88 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6928  SNARE associated Golgi protein  38.79 
 
 		 224 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  34.05 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  33.97 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  32.4 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  34.21 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  32.2 
 
 		 244 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1453  hypothetical protein  35.03 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  31.32 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  35.03 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  32.46 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  34.65 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  38.82 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  36.02 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  31.09 
 
 		 279 aa  97.1  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  33.52 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  32.61 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.16 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>