155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2880 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  630  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  40.9 
 
 		 335 aa  228  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  39.77 
 
 		 345 aa  225  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  40.79 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  39.63 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  41.05 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  39.32 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  38.81 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  39.58 
 
 		 329 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  37.76 
 
 		 337 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2828  putative transposase  32.22 
 
 		 338 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.949777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  31.93 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  32.74 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  31.71 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  33.73 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  32.35 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  32.06 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  28.07 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  32.97 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  30.74 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  30.74 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  30.74 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  32.26 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  32.62 
 
 		 311 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  26.96 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  30.63 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  32.62 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  27.73 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  26.01 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  31.07 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  30.69 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  30.69 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  30.56 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  30.69 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  30.32 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  31.14 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  28.81 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  32.5 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  31.65 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  30.39 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  30.39 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  30.39 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  30.55 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  30.55 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  30.55 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  30.5 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  31.33 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  30.39 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  29.54 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  30.55 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  30.55 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  29.78 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  31.56 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  29.82 
 
 		 296 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  31.88 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  30.04 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  31.18 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  30.04 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  31.18 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1247  hypothetical protein  24.48 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  31.07 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  23.73 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  30.57 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  28.57 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  30.04 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  30.04 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  30 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  30.8 
 
 		 313 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  30.8 
 
 		 313 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  30.8 
 
 		 313 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  29.59 
 
 		 255 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1309  hypothetical protein  25.25 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  30 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  30.88 
 
 		 298 aa  92.4  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  29.57 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  27.14 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  27.14 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  27.14 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  27.14 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  27.14 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  27.14 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  27.92 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  27.14 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  28.26 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0492  hypothetical protein  21.1 
 
 		 312 aa  90.1  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  28.99 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  28.99 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  35.29 
 
 		 141 aa  89.4  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  26.11 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  27.3 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0643  hypothetical protein  23.9 
 
 		 247 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.460705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  26.15 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2307  hypothetical protein  27.49 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000450312  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  31.11 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>