More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2424 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2424  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 785 aa  1526    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271655  normal  0.0697839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4944  serine/threonine protein kinase  66 
 
 		 763 aa  794    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208032  normal  0.80492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3064  serine/threonine protein kinase  47.29 
 
 		 785 aa  527  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.790992  hitchhiker  0.000000827002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37200  protein kinase family protein  44.99 
 
 		 832 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0181  serine/threonine protein kinase  45.63 
 
 		 774 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2161  serine/threonine protein kinase  42.2 
 
 		 765 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3509  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 		 1011 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2811  serine/threonine protein kinase  43.01 
 
 		 730 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2462  serine/threonine protein kinase  42.19 
 
 		 775 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00574748  normal  0.765931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4555  serine/threonine protein kinase  38.88 
 
 		 776 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.550523 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0703  protein kinase  41.41 
 
 		 755 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00413677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0540  serine/threonine protein kinase  40.45 
 
 		 759 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.623105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0552  serine/threonine protein kinase  40.45 
 
 		 759 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.274809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0530  serine/threonine protein kinase  40.45 
 
 		 759 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10415  serine/threonine-protein kinase pknG  40.79 
 
 		 750 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4405  serine/threonine protein kinase  40.98 
 
 		 781 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0202  protein kinase  39.77 
 
 		 766 aa  392  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3755  serine/threonine protein kinase  39.61 
 
 		 773 aa  388  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512149  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4396  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.87 
 
 		 867 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.958962  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0399  serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 		 707 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0370  serine/threonine protein kinase  40.94 
 
 		 444 aa  198  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519534  hitchhiker  0.00254461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2531  serine/threonine protein kinase  38.48 
 
 		 758 aa  184  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3687  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 		 416 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.517682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  27.82 
 
 		 403 aa  97.8  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  30.97 
 
 		 457 aa  97.4  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  32.79 
 
 		 1046 aa  97.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  29.89 
 
 		 620 aa  97.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2423  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 		 718 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 		 590 aa  94.4  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 414 aa  93.6  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 		 381 aa  94  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  32.51 
 
 		 360 aa  94  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.91 
 
 		 1607 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.18 
 
 		 668 aa  93.6  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.93 
 
 		 1583 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  31.12 
 
 		 1053 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.65 
 
 		 1398 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.91 
 
 		 1598 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  28.99 
 
 		 614 aa  90.9  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  30.57 
 
 		 427 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 		 564 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  34.9 
 
 		 1032 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33.99 
 
 		 646 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0207  kinase domain protein  30.39 
 
 		 637 aa  89.4  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.6 
 
 		 1626 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  32.34 
 
 		 790 aa  89.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  31.72 
 
 		 329 aa  89  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 		 791 aa  88.2  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  28.34 
 
 		 618 aa  87.8  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  31.38 
 
 		 329 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.19 
 
 		 1190 aa  87.4  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.3 
 
 		 653 aa  87.4  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3475  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 		 425 aa  87.4  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0338486  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  30.96 
 
 		 700 aa  87.8  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 		 612 aa  87  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.09 
 
 		 647 aa  87  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.08 
 
 		 1684 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 892 aa  87.4  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  31.8 
 
 		 325 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  29.66 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  30.04 
 
 		 1057 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  27.25 
 
 		 871 aa  86.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1183  protein kinase  30.1 
 
 		 475 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  27.96 
 
 		 888 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.27 
 
 		 700 aa  85.1  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 861 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 928 aa  85.1  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  28.57 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  30.49 
 
 		 519 aa  85.1  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.62 
 
 		 1183 aa  84.7  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  24.63 
 
 		 915 aa  84.3  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.74 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 		 863 aa  84  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.19 
 
 		 602 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.09 
 
 		 1267 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2707  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  29.49 
 
 		 457 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0226952  unclonable  0.000000000187188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2668  serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 		 853 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0795724  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.93 
 
 		 664 aa  82.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  28.01 
 
 		 617 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.52 
 
 		 528 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.76 
 
 		 1609 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.1 
 
 		 627 aa  82.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1135  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  28.37 
 
 		 951 aa  82.4  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 895 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  32.6 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.87 
 
 		 635 aa  82.4  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.32 
 
 		 673 aa  82.4  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.51 
 
 		 599 aa  82  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 		 528 aa  82  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 		 498 aa  82  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 		 642 aa  81.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 776 aa  81.6  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.67 
 
 		 681 aa  81.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>