169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1882 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1882  transposase  100 
 
 		 178 aa  361  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  66.35 
 
 		 376 aa  258  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  66.35 
 
 		 365 aa  258  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  45.89 
 
 		 391 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1018  ISRSO5-transposase protein  44.93 
 
 		 387 aa  160  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1967  ISRSO5-transposase protein  44.93 
 
 		 387 aa  160  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2084  ISRSO5-transposase protein  44.93 
 
 		 387 aa  160  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  34.83 
 
 		 376 aa  97.4  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  36.16 
 
 		 353 aa  92.8  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  38.67 
 
 		 285 aa  91.3  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  39.33 
 
 		 351 aa  90.9  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  39.33 
 
 		 351 aa  90.9  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  38.67 
 
 		 351 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  31.05 
 
 		 377 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  36.42 
 
 		 363 aa  88.6  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  36.42 
 
 		 363 aa  88.6  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  36.42 
 
 		 363 aa  88.6  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  36.42 
 
 		 363 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  36.42 
 
 		 363 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  36.42 
 
 		 363 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  36.42 
 
 		 363 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  36.42 
 
 		 583 aa  87.4  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  34.48 
 
 		 357 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  34.48 
 
 		 357 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  30.59 
 
 		 377 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  34.48 
 
 		 357 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  34.48 
 
 		 357 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  34.48 
 
 		 357 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  33.85 
 
 		 346 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  36.05 
 
 		 282 aa  85.1  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  30.14 
 
 		 377 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  30.14 
 
 		 377 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  30.14 
 
 		 377 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  30.14 
 
 		 377 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  30.14 
 
 		 377 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  30.14 
 
 		 377 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  30.14 
 
 		 377 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  30.14 
 
 		 377 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  30.14 
 
 		 377 aa  84.3  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  32.69 
 
 		 377 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  36.49 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  36.49 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  36.49 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  38.46 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  31.12 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  32 
 
 		 390 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  32.96 
 
 		 374 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0784  feruloyl esterase  33.85 
 
 		 346 aa  77.8  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  32.31 
 
 		 355 aa  77.8  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2481  integrase catalytic subunit  35.81 
 
 		 343 aa  77.8  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  35.81 
 
 		 353 aa  77.8  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  31.47 
 
 		 362 aa  77.8  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  35.81 
 
 		 353 aa  77.4  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0107  Integrase catalytic region  32.49 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.826939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  36.49 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  35.81 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  30.29 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1344  Integrase catalytic region  32.49 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.938406  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  31.11 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  31.11 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  31.11 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  31.11 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  31.11 
 
 		 363 aa  74.7  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  31.47 
 
 		 366 aa  74.7  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  31.11 
 
 		 363 aa  74.7  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3419  putative transposase  34.75 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  34.18 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  35.81 
 
 		 364 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  35.81 
 
 		 364 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  32.49 
 
 		 367 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  35.81 
 
 		 364 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  35.81 
 
 		 364 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  35.81 
 
 		 364 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  35.81 
 
 		 364 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  35.81 
 
 		 364 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  35.81 
 
 		 364 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  35.81 
 
 		 364 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0526  ISRSO5-transposase protein  32.99 
 
 		 363 aa  72  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  39.53 
 
 		 356 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  39.53 
 
 		 356 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  39.53 
 
 		 356 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  35.06 
 
 		 354 aa  71.6  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  32.99 
 
 		 375 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  31.98 
 
 		 370 aa  71.2  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  28.65 
 
 		 379 aa  70.9  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  33.17 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  35.26 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  35.26 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  31.46 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  31.46 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0110  ISRSO5-transposase protein  32.65 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0937273  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0637  ISRSO5-transposase protein  32.65 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3393  ISRSO5-transposase protein  32.65 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0217  ISRSO5-transposase protein  32.65 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.070474 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  31.98 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  31.98 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  31.98 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  33.33 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  33.33 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  33.33 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>