73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0971 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0971  FHA domain-containing protein  100 
 
 
183 aa  352  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6885  FHA domain-containing protein  43.87 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4342  FHA domain-containing protein  49.74 
 
 
182 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112903  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  44.09 
 
 
851 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  44.26 
 
 
856 aa  97.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  51 
 
 
933 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.98 
 
 
838 aa  94.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  51.06 
 
 
895 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  52.53 
 
 
849 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  54.17 
 
 
252 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  44.44 
 
 
238 aa  55.1  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  48.68 
 
 
326 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  48.68 
 
 
326 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  41.07 
 
 
279 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  39.76 
 
 
241 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  47.37 
 
 
338 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  39.73 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  42.68 
 
 
312 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1377  hypothetical protein  39.19 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07300  FHA domain-containing protein  39.06 
 
 
144 aa  48.9  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  30.14 
 
 
134 aa  48.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2456  FHA domain-containing protein  42.37 
 
 
201 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00798291  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0077  FHA domain containing protein  47.37 
 
 
234 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.43292  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  41.46 
 
 
861 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0083  FHA domain containing protein  36.96 
 
 
394 aa  48.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2647  FHA domain containing protein  42.37 
 
 
206 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1581  FHA domain containing protein  34.62 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.10755 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2551  FHA domain containing protein  42.37 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0036  FHA domain protein  37.84 
 
 
233 aa  47  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26930  FHA domain-containing protein  40.58 
 
 
237 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.583878  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  32 
 
 
796 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  47.17 
 
 
310 aa  45.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
848 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1309  FHA domain-containing protein  40.68 
 
 
206 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0844943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0147  FHA domain containing protein  41.67 
 
 
137 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13440  FHA domain-containing protein  34.72 
 
 
149 aa  44.7  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5252  FHA domain containing protein  40.35 
 
 
255 aa  44.3  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.691426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
268 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.94 
 
 
606 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  37.93 
 
 
518 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  36.51 
 
 
242 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00800  FHA domain-containing protein  38.33 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151264  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  39.02 
 
 
869 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4430  FHA domain-containing protein  34.21 
 
 
440 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.206404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.57 
 
 
863 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1302  FHA domain containing protein  33.7 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  32.43 
 
 
299 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1775  hypothetical protein  27.21 
 
 
302 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00409515  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  36.07 
 
 
267 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  37.35 
 
 
557 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0150052  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0382  hypothetical protein  27.04 
 
 
318 aa  42.4  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0186101  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4219  Forkhead-associated protein  41.79 
 
 
224 aa  42.4  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6306  FHA domain containing protein  38.89 
 
 
307 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3938  FHA domain-containing protein  37.35 
 
 
529 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  41.38 
 
 
866 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0365  FHA domain containing protein  29.13 
 
 
118 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1259  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 
707 aa  41.6  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  38.96 
 
 
177 aa  41.2  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  37.08 
 
 
245 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  45.07 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  36.96 
 
 
387 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4979  FHA domain-containing protein  41.3 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232716  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1189  FHA domain-containing protein  48 
 
 
162 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.280321  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0136  FHA domain containing protein  37.88 
 
 
177 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.240573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  32.98 
 
 
863 aa  41.2  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13396  hypothetical protein  30.25 
 
 
122 aa  41.2  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0921482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4708  FHA domain containing protein  33.01 
 
 
173 aa  41.2  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974304 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  34.02 
 
 
751 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10020  hypothetical protein  32.94 
 
 
527 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  37.33 
 
 
866 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4002  FHA domain-containing protein-like protein  41.27 
 
 
171 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759759  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  37.33 
 
 
866 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2707  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  37.5 
 
 
457 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0226952  unclonable  0.000000000187188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>