More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0722 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0722  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 472 aa  953    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.693159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5892  glycosyl transferase family protein  76.99 
 
 		 476 aa  715    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.861107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  44.02 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  50.82 
 
 		 335 aa  109  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  40.96 
 
 		 300 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  43.97 
 
 		 1340 aa  95.1  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  44.12 
 
 		 337 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  36.87 
 
 		 307 aa  93.2  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 		 320 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 		 355 aa  90.1  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  34.72 
 
 		 822 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 		 331 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 318 aa  87.4  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  34.72 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  31.94 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 		 328 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  44.21 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 		 836 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 		 841 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  46.32 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  40.38 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  28.79 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 359 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  27.72 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0130  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0102341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  35.12 
 
 		 838 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  30.66 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.65 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  33.93 
 
 		 652 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  41.51 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0524  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 		 841 aa  73.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  46.75 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 		 342 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.96 
 
 		 355 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 313 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  38.64 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  39.05 
 
 		 312 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  43.75 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 		 714 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  42.55 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 1268 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  37.07 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  43.14 
 
 		 679 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  36.46 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  38.83 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  35.48 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  38.64 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 		 282 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0513  glycosyl transferase family protein  36.64 
 
 		 355 aa  69.7  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.149546  normal  0.0426124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0059  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 		 335 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  34.11 
 
 		 2401 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  41.9 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  37.4 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  29.37 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  28.26 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  35.54 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  37.36 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 336 aa  67  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 319 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 		 300 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 302 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 1267 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 1523 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  36.79 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  28.48 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.34 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 1267 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>