More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1113 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  81.82 
 
 		 122 aa  206  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  69.83 
 
 		 124 aa  167  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  66.38 
 
 		 124 aa  167  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0765  ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 125 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 125 aa  158  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 		 122 aa  156  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  62.28 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  64.91 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  64.91 
 
 		 116 aa  154  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  63.16 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 127 aa  153  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  57.72 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  65.18 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  62.83 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  61.21 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  62.28 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  62.83 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  57.89 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  150  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  63.16 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  62.07 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  60.18 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  57.72 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  56.2 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  61.06 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  59.65 
 
 		 123 aa  146  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  61.06 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 123 aa  146  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 		 123 aa  146  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  56.14 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  61.06 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  54.55 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  61.95 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  55.26 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  60.18 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  59.82 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  59.29 
 
 		 122 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  56.1 
 
 		 123 aa  144  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  57.76 
 
 		 123 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2036  30S ribosomal protein S13  61.61 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.818597  normal  0.51135 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 129 aa  144  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  56.14 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  59.29 
 
 		 122 aa  144  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  56.1 
 
 		 126 aa  143  6e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  56.9 
 
 		 122 aa  143  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  59.29 
 
 		 122 aa  144  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  55.17 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  143  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  61.06 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  60.18 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  61.61 
 
 		 123 aa  143  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0331  30S ribosomal protein S13  60.71 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1930  30S ribosomal protein S13  60.71 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  58.41 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  56.03 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  59.29 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  55.37 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5048  30S ribosomal protein S13  60.18 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0590197  normal  0.99624 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0344  30S ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000253424  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  52.07 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>