More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2944 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2944  glutathione peroxidase  100 
 
 
195 aa  398  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0986023  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  68.15 
 
 
170 aa  232  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  55.77 
 
 
177 aa  178  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2679  glutathione peroxidase  48.66 
 
 
194 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0040  Peroxiredoxin  54.97 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0496109 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  48.65 
 
 
158 aa  164  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  44.59 
 
 
158 aa  158  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  46.67 
 
 
163 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  43.48 
 
 
165 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  44.87 
 
 
179 aa  154  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  47.37 
 
 
161 aa  154  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  45.39 
 
 
159 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  44.51 
 
 
182 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  45.83 
 
 
159 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  40.37 
 
 
166 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  44.74 
 
 
159 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  45.83 
 
 
159 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  46.15 
 
 
160 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  45.83 
 
 
159 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1579  glutathione peroxidase  52.9 
 
 
164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0189646  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  45.14 
 
 
159 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  45.1 
 
 
165 aa  151  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  42.24 
 
 
165 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  42.24 
 
 
165 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  42.24 
 
 
165 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  44.44 
 
 
161 aa  150  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  43.15 
 
 
163 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  43.05 
 
 
161 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  44.44 
 
 
161 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  43.31 
 
 
162 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  44.06 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  46.36 
 
 
160 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  44.06 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  44.06 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  44.06 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  44.06 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  44.06 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  43.79 
 
 
161 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  46.36 
 
 
160 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  44.06 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  43.15 
 
 
161 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  43.59 
 
 
160 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  45.7 
 
 
160 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  43.59 
 
 
160 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  44.74 
 
 
162 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  44.06 
 
 
159 aa  148  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  46.36 
 
 
165 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  41.4 
 
 
160 aa  148  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  43.42 
 
 
160 aa  147  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  42.95 
 
 
160 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  47.45 
 
 
161 aa  147  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  45.7 
 
 
160 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  43.66 
 
 
161 aa  147  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  45.7 
 
 
165 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  43.23 
 
 
162 aa  147  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  40.13 
 
 
162 aa  147  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  43.66 
 
 
161 aa  147  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78456  glutathione peroxidase  50.74 
 
 
160 aa  147  9e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.437317  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  45.03 
 
 
161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  42.31 
 
 
160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  45.39 
 
 
158 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  47.59 
 
 
161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  44.06 
 
 
161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  42.96 
 
 
163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  45.83 
 
 
158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  43.05 
 
 
165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  45.03 
 
 
160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  44.83 
 
 
160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  45.83 
 
 
158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  45.03 
 
 
160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  43.06 
 
 
158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  43.05 
 
 
165 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  45.83 
 
 
158 aa  145  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  44.97 
 
 
165 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  41.4 
 
 
162 aa  145  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  45.03 
 
 
160 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  39.07 
 
 
168 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  42.58 
 
 
158 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  45.14 
 
 
160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  44.76 
 
 
158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  45.07 
 
 
164 aa  145  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  43.23 
 
 
161 aa  145  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  42.76 
 
 
159 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  42.76 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  44.76 
 
 
159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  42.38 
 
 
161 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  45.03 
 
 
160 aa  144  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  41.4 
 
 
165 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  45.03 
 
 
160 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  43.75 
 
 
158 aa  144  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  43.75 
 
 
158 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  45.1 
 
 
158 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  42.76 
 
 
161 aa  143  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  41.4 
 
 
165 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  42.53 
 
 
182 aa  143  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  40.56 
 
 
161 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  44.76 
 
 
157 aa  143  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  41.55 
 
 
164 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  42.55 
 
 
161 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  42.38 
 
 
165 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>