283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2520 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2520  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
354 aa  721    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2876  hypothetical protein  41.95 
 
 
359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06145  hypothetical protein  38.08 
 
 
339 aa  245  9e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.871394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3091  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  28.13 
 
 
359 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  26.9 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  21.84 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  23.83 
 
 
344 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.95 
 
 
352 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  25.26 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.73 
 
 
360 aa  82.4  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.96 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1991  glycosyl transferase family protein  21.25 
 
 
351 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.010394  normal  0.201882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.64 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.64 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.64 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.64 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.91 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.19 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  21.6 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  21.03 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21 
 
 
353 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.33 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.26 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.92 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  20.53 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.92 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.92 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1247  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.43 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.313368  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.66 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.1 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.58 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  23.03 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
392 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0778  glycosyl transferase family 9  21.22 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.09 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  21.36 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.09 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.25 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.09 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  33.08 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.15 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.05 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.38 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  28.47 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.21 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.28 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  21.77 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  18.46 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.28 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  21.28 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  21.05 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  21.75 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  24.36 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.34 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.34 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.34 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  22.05 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03477  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  21.12 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000025219  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03428  hypothetical protein  21.12 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000123646  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0085  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000038978  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.58 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4047  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4993  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  19.66 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  21.93 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  22.26 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  21.93 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000276456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1703  glycosyl transferase family 9  20.63 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4123  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0437858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  21.93 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  20.92 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.72 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  22.41 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  19.94 
 
 
361 aa  63.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  23.05 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0159  glycosyl transferase family protein  22.52 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  18.33 
 
 
779 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.23 
 
 
516 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  20.06 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  20.59 
 
 
381 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.92 
 
 
356 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  21.33 
 
 
333 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  21.82 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 
357 aa  60.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0561  glycosyl transferase family protein  21.96 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0753  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.95 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.171103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  21.1 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.53 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  19.93 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>