More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2278 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2538  valyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 897 aa  690    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 887 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0977  valyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 948 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1132  valyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 		 876 aa  1116    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 909 aa  637    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 876 aa  717    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 921 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 879 aa  711    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 881 aa  713    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 955 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 883 aa  668    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 879 aa  731    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1457  valyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 874 aa  668    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 907 aa  670    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 881 aa  712    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 881 aa  711    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3006  valyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 909 aa  656    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 881 aa  709    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2855  valyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 921 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 921 aa  665    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 921 aa  664    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4694  valyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 906 aa  636    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0504  valyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 884 aa  685    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000238585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 943 aa  656    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 881 aa  694    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 904 aa  655    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 912 aa  653    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 885 aa  684    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1531  valyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 888 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 881 aa  693    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 929 aa  643    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5237  valyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 906 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 865 aa  711    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 885 aa  689    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1477  valyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 1052 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516539  normal  0.491266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0386  valyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 901 aa  720    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.673451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 943 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0388  valyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 902 aa  728    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.427268  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42662  predicted protein  38.89 
 
 		 924 aa  647    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 887 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 883 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 924 aa  669    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 881 aa  712    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2278  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 877 aa  1810    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2006  valyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 910 aa  677    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2634 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 909 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 926 aa  659    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 879 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 880 aa  681    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4237  valyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 930 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19671  normal  0.989502 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0291  valyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 890 aa  702    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1755  valyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 876 aa  725    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.746599  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 892 aa  743    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2036  valyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 918 aa  717    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.895366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 922 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 952 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 943 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0406  valyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 904 aa  697    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1279  valyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 950 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4005  valyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 927 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.311642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 881 aa  712    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 884 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 954 aa  638    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 881 aa  720    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1836  valyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 902 aa  716    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.66816  normal  0.802298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 929 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2381  valyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 903 aa  712    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1092  valyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 896 aa  649    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.75364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 884 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 866 aa  689    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 921 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 926 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2435  valyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 		 880 aa  1088    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 880 aa  714    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 880 aa  707    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 881 aa  711    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01578  valyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 924 aa  666    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.337374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 865 aa  700    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1721  valyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 876 aa  725    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 917 aa  668    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 867 aa  711    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 883 aa  715    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 893 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0983  valyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 948 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14440  valyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 950 aa  648    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 880 aa  686    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 902 aa  668    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 879 aa  667    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 894 aa  690    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 883 aa  681    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1256  valyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 877 aa  1015    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 892 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 929 aa  662    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1015  valyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 948 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 917 aa  659    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 886 aa  678    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2029  valyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 904 aa  711    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 953 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 884 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 886 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>