44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1350 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  100 
 
 
239 aa  473  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  33.89 
 
 
240 aa  149  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  32.77 
 
 
242 aa  123  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000195212  hitchhiker  0.00000209899 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  23.48 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  26.2 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  25.94 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  31.69 
 
 
242 aa  62  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  27.83 
 
 
245 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  26.32 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  25.85 
 
 
245 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  27.53 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2458  hypothetical protein  22.79 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.223806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  25.51 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
242 aa  55.1  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  26.53 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  26.86 
 
 
245 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  25.51 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  25.9 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  25.31 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  30.08 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  26.34 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  24.19 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  25.82 
 
 
246 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  25.69 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  20.94 
 
 
237 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  22.73 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  24.5 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  24.5 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  30.53 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  30.53 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  30.53 
 
 
245 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  23.29 
 
 
256 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1949  protein of unknown function DUF164  21.95 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.403307  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  24.5 
 
 
239 aa  45.8  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  26.27 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  24.2 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  28.86 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  27.18 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  26.4 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  32.3 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  20.38 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  25.4 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  19.37 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  23.78 
 
 
231 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>