More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4897 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  268  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0552  endoribonuclease L-PSP  86.82 
 
 		 132 aa  226  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.897554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0090  endoribonuclease L-PSP  76.74 
 
 		 130 aa  190  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0741494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3111  Endoribonuclease L-PSP  72.87 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0675  putative endoribonuclease L-PSP  64.29 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0179  endoribonuclease L-PSP, putative  64.8 
 
 		 128 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0838  YjgF family protein  64.8 
 
 		 128 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2390  putative endoribonuclease L-PSP  64.8 
 
 		 128 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0560  endoribonuclease L-PSP  64.8 
 
 		 128 aa  163  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0547  endoribonuclease L-PSP, putative  64.8 
 
 		 128 aa  163  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0660  endoribonuclease L-PSP  64.8 
 
 		 128 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2768  putative endoribonuclease L-PSP  64.8 
 
 		 128 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6067  endoribonuclease L-PSP  64 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2789  endoribonuclease L-PSP  64 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2656  endoribonuclease L-PSP  64 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  63.71 
 
 		 128 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  63.71 
 
 		 128 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  63.71 
 
 		 128 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  67.74 
 
 		 128 aa  157  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  67.74 
 
 		 128 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2310  putative endoribonuclease L-PSP  66.96 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650904  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  59.84 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6248  translation initiation inhibitor  57.36 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  66.13 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  57.94 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4194  Endoribonuclease L-PSP  65.08 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4304  Endoribonuclease L-PSP  65.08 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  64.29 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  63.49 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 129 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  57.48 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  61.6 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2507  endoribonuclease L-PSP  55.91 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.022272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2779  endoribonuclease L-PSP family protein  55.91 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0969  endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 133 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401025  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06352  ribonuclease  81.32 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  42.52 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  42.52 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  41.07 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 125 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  43.64 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  37.61 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  37.61 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  35.45 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  36.94 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  37.04 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3322  endoribonuclease L-PSP  42.35 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939467  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23720  putative translation initiation inhibitor  36.11 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0143605 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  35.96 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  32.38 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  36.04 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>