84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4860 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  100 
 
 		 422 aa  860    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  42.31 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 		 419 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  33.09 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  33.09 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 421 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  33.09 
 
 		 421 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  31.33 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 421 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  28.71 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  29.37 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 438 aa  193  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  28.71 
 
 		 425 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  29.92 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  29.92 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  28.47 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 440 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  29.69 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 433 aa  155  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 214 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  23.51 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 207 aa  97.4  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  22.08 
 
 		 497 aa  89.4  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  22.82 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  23.03 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1684  hypothetical protein  43.06 
 
 		 90 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  22.77 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  22.08 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1683  hypothetical protein  34.18 
 
 		 82 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  30.14 
 
 		 103 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0212  sugar phosphate antiporter  22.01 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0206  sugar phosphate antiporter  22.01 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  23.04 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 430 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  22.81 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  22.92 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  22.27 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  23.11 
 
 		 430 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  22.92 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1682  hypothetical protein  25 
 
 		 123 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3259  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867581 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  22.16 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  23.17 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  22.16 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000112087  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  22.47 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  29.87 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  36 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  28.57 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  29.87 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  23.75 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  22.3 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2103  major facilitator transporter  21.73 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.552492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.88 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  21.67 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 390 aa  44.3  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2341  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.46 
 
 		 450 aa  43.1  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  21.83 
 
 		 449 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  23.17 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>