More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3170 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  100 
 
 		 304 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  96.38 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  97.28 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  81.13 
 
 		 303 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  74.75 
 
 		 305 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  74.75 
 
 		 305 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  74.43 
 
 		 305 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  74.43 
 
 		 305 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  74.43 
 
 		 305 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  70.13 
 
 		 310 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  72.2 
 
 		 324 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  66.11 
 
 		 301 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  68.29 
 
 		 300 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  66.21 
 
 		 302 aa  419  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  67.77 
 
 		 316 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  62.5 
 
 		 304 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  66.3 
 
 		 305 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  66.54 
 
 		 304 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  68.54 
 
 		 310 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  61.36 
 
 		 322 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  61.02 
 
 		 311 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  61.02 
 
 		 322 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  65.56 
 
 		 296 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  66.79 
 
 		 314 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  61.05 
 
 		 286 aa  381  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  61.3 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  64.23 
 
 		 297 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0249  periplasmic solute binding protein  63 
 
 		 299 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.746971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  64.68 
 
 		 301 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  59.63 
 
 		 341 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  60.15 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  55.16 
 
 		 326 aa  325  7e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  51.85 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  52.57 
 
 		 313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  50 
 
 		 305 aa  298  8e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  50.92 
 
 		 321 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  49.82 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  46.82 
 
 		 290 aa  293  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  52.96 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3371  periplasmic solute binding protein  51.43 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131803 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  49.45 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  47.7 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  45.14 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  45.78 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  43.39 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4439  periplasmic solute binding protein  48.71 
 
 		 304 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  49.46 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  44.12 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0601  ABC transporter substrate-binding protein  40.85 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06271  ABC transporter substrate-binding protein  42.48 
 
 		 302 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06571  ABC transporter substrate-binding protein  42.48 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351556  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06661  ABC transporter substrate-binding protein  40.33 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.391111  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  35.02 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  35.2 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  34.65 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  34.65 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  34.65 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  37.24 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  38.32 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  33.9 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.26 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  34.01 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  32.44 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  36.13 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  35.19 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  34.21 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  35.4 
 
 		 303 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  33.68 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  33.01 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  34.95 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  32.88 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  32.88 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  32.88 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  36.86 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.3 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  32.8 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  33.81 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  32.62 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  32.89 
 
 		 311 aa  168  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  34.53 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  31.65 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  34.43 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.78 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  33.82 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  31.82 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  32.76 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 326 aa  158  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  30.62 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  30.45 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  31.29 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  32.55 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  32.7 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  31.02 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  30.88 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  32.54 
 
 		 344 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>