160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2261 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  100 
 
 
307 aa  638    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  98.05 
 
 
307 aa  625  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  59.74 
 
 
307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  59.74 
 
 
307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  59.74 
 
 
307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  59.74 
 
 
307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  59.09 
 
 
307 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  59.42 
 
 
307 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  59.42 
 
 
307 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  58.77 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  58.77 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  58.77 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  58.77 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  60.39 
 
 
306 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  60.39 
 
 
306 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  60.39 
 
 
306 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  59.09 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  58.77 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  58.77 
 
 
307 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  58.77 
 
 
307 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  60.39 
 
 
306 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  60.53 
 
 
306 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  61.18 
 
 
306 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  60.53 
 
 
306 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  58.12 
 
 
307 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  61.18 
 
 
306 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  58.44 
 
 
307 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  58.44 
 
 
307 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  58.44 
 
 
307 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  58.44 
 
 
307 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  58.44 
 
 
307 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  61.18 
 
 
306 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  61.18 
 
 
306 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  60.86 
 
 
306 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  60.86 
 
 
306 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  60.86 
 
 
306 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  60.86 
 
 
306 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  58.12 
 
 
307 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  57.79 
 
 
307 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  58.77 
 
 
306 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  57.79 
 
 
306 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  57.47 
 
 
306 aa  381  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  58.44 
 
 
306 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  56.58 
 
 
307 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  58.8 
 
 
300 aa  377  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  58.42 
 
 
302 aa  371  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  61.75 
 
 
289 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  61.68 
 
 
282 aa  354  8.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  54.49 
 
 
305 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  52.77 
 
 
305 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  52.44 
 
 
320 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2010  transposase, IS4 family protein  56.85 
 
 
262 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242542  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  53.25 
 
 
245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  59.45 
 
 
220 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  53.74 
 
 
226 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3145  transposase, IS4 family protein  61.08 
 
 
198 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075025  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0087  transposase  42.72 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4125  transposase, IS4 family protein  42.77 
 
 
319 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0801199 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4439  transposase, IS4 family protein  61.4 
 
 
171 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4434  transposase, IS4 family protein  41.48 
 
 
319 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0276  transposase, IS4 family protein  41.48 
 
 
319 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2789  transposase, IS4 family protein  40.43 
 
 
301 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5743  transposase IS4 family protein  41.64 
 
 
304 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427629  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4655  transposase IS4 family protein  35.96 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515802  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  61.27 
 
 
145 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0892  transposase IS4 family protein  35.28 
 
 
310 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.444367  normal  0.700917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2610  transposase, IS4 family protein  36.89 
 
 
322 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0191449 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  52.38 
 
 
176 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  51.7 
 
 
176 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  54.35 
 
 
143 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1661  transposase, IS4 family protein  50.76 
 
 
132 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  54.69 
 
 
132 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  54.69 
 
 
132 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  53.49 
 
 
128 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06919  hypothetical protein  57.26 
 
 
126 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1660  transposase IS4 family protein  47.65 
 
 
167 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000446098  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05983  hypothetical protein  61.22 
 
 
100 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0610  transposase, IS4 family protein  51.82 
 
 
111 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0196  transposase, IS4 family protein  29.54 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.658877  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0343  transposase, IS4 family protein  29.54 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.516118  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0519  transposase, IS4 family protein  29.54 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0652  transposase, IS4 family protein  29.54 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.730193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0860  transposase, IS4 family protein  29.54 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0969  transposase, IS4 family protein  29.54 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1023  transposase, IS4 family protein  29.54 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1184  transposase, IS4 family protein  29.54 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0697073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1595  transposase, IS4 family protein  29.54 
 
 
289 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.51205  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7117  transposase  34.48 
 
 
181 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0991  hypothetical protein  44.79 
 
 
126 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.193632 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2514  transposase IS4 family protein  26.22 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  46.02 
 
 
113 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7120  transposase  45.92 
 
 
108 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0343  transposase  56.94 
 
 
72 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6001  hypothetical protein  34.07 
 
 
150 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.186045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0948  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
299 aa  87  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1118  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
299 aa  87  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2578  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
299 aa  87  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2684  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
299 aa  87  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3055  putative transposase  53.42 
 
 
74 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6088  hypothetical protein  37.61 
 
 
176 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>