More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0484 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0484  ROK familiy protein  100 
 
 		 291 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03082  N-acetylmannosamine kinase  98.28 
 
 		 291 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03033  hypothetical protein  98.28 
 
 		 291 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0484  N-acetylmannosamine kinase  98.28 
 
 		 291 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3410  N-acetylmannosamine kinase  97.94 
 
 		 291 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3704  N-acetylmannosamine kinase  97.59 
 
 		 291 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.338423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3517  N-acetylmannosamine kinase  97.25 
 
 		 291 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4539  N-acetylmannosamine kinase  97.25 
 
 		 291 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3554  N-acetylmannosamine kinase  95.19 
 
 		 291 aa  501  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3529  N-acetylmannosamine kinase  75.6 
 
 		 291 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3696  N-acetylmannosamine kinase  75.6 
 
 		 291 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3599  N-acetylmannosamine kinase  75.6 
 
 		 291 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3527  N-acetylmannosamine kinase  75.6 
 
 		 291 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3634  N-acetylmannosamine kinase  75.26 
 
 		 291 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3659  N-acetylmannosamine kinase  73.36 
 
 		 289 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  50.35 
 
 		 290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  50.35 
 
 		 290 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  50.35 
 
 		 290 aa  269  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  48.45 
 
 		 292 aa  262  6e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1379  N-acetylmannosamine kinase  41.2 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0354  ROK family protein  39.16 
 
 		 525 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0411  ROK family protein  39.93 
 
 		 525 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1520  ROK family protein  38.19 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.969416  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  34.31 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  38.46 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1173  ROK domain-containing protein  39.24 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.71 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  34.55 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0965  glucokinase  40.16 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.633667  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  33.44 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0983  glucokinase  40.16 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157421  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  33.01 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  36.21 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.69 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  33.02 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.09 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  30.6 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.37 
 
 		 315 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.37 
 
 		 315 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0993  glucokinase  39.76 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  33.55 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.9 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  33.45 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  36.33 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.35 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  32.3 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  30.94 
 
 		 317 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  33.01 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0242  ROK domain-containing protein  34.36 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.981562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.74 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  32.89 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2260  ROK family protein  42.55 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.149856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  34.97 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  32.18 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.01 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  33.01 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  31.6 
 
 		 306 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  29.62 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  34.65 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  28.25 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  33.33 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  29.34 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  29.34 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  29.34 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  29.34 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  29.34 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  29.34 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  29.34 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  34.06 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  33.33 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.21 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  29.34 
 
 		 327 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  31.29 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  28.42 
 
 		 298 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  30.19 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  29.02 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  29.02 
 
 		 327 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1371  glucokinase  31.89 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  29.02 
 
 		 327 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  28.76 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  31.75 
 
 		 334 aa  99  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  31.75 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  31.34 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  32.81 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  34.42 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  32.08 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  30.03 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  30.91 
 
 		 314 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  29.87 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  37.95 
 
 		 255 aa  96.3  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  30.5 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  34.22 
 
 		 314 aa  95.9  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1071  ROK family protein  34.63 
 
 		 315 aa  95.5  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  33.33 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  27.39 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  31.48 
 
 		 307 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  30.74 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  32.61 
 
 		 361 aa  93.2  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  38.92 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>