More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1939 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  99.36 
 
 		 472 aa  976    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  99.79 
 
 		 472 aa  978    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  99.79 
 
 		 472 aa  978    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  99.79 
 
 		 472 aa  978    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  99.36 
 
 		 472 aa  972    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  99.79 
 
 		 472 aa  978    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  100 
 
 		 472 aa  981    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  81.99 
 
 		 472 aa  813    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  99.36 
 
 		 472 aa  976    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  80.08 
 
 		 472 aa  800    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  99.15 
 
 		 472 aa  973    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  50.85 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  47.56 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  44.72 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  44.72 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  44.12 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  44.35 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  44.94 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  44.12 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  44.27 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  44.72 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  44.57 
 
 		 460 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  44.72 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  44.72 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  44.94 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  44.04 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  44.17 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  43.82 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  43.82 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  43.6 
 
 		 458 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  44.49 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  44.75 
 
 		 451 aa  359  6e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  40.62 
 
 		 461 aa  356  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  42.76 
 
 		 459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  39.38 
 
 		 459 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  39.47 
 
 		 466 aa  325  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  40.68 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  35.68 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  37.92 
 
 		 468 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  37.92 
 
 		 464 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  37.56 
 
 		 464 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  37.5 
 
 		 455 aa  296  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  38.36 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  36.3 
 
 		 453 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  38.5 
 
 		 455 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  37.78 
 
 		 455 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  37.81 
 
 		 459 aa  292  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  38.34 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  38.68 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  38.34 
 
 		 448 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  38.22 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  36.81 
 
 		 455 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  35.96 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  37.47 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  37.39 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  37.03 
 
 		 450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  37.17 
 
 		 459 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  37.39 
 
 		 454 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  37.44 
 
 		 448 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  36.63 
 
 		 445 aa  272  9e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  37.96 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  36.96 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  37.17 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  37.31 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  36.4 
 
 		 445 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  36.4 
 
 		 445 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1253  glutamine synthetase, catalytic region  37.06 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2634  glutamate--putrescine ligase  36.89 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0507413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  36.78 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  36.78 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  36.78 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1397  glutamate--ammonia ligase  37.1 
 
 		 452 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  37.11 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  37.83 
 
 		 471 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  37.53 
 
 		 448 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  35.42 
 
 		 451 aa  264  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  37.03 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  37 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1125  L-glutamine synthetase  36.32 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.441387  normal  0.264596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  36.73 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  41.49 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3944  glutamate--putrescine ligase  36.36 
 
 		 466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2226  glutamine synthetase family protein  35.53 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  36.28 
 
 		 452 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1297  glutamate--putrescine ligase  35.45 
 
 		 463 aa  253  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770979  normal  0.671991 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  36.73 
 
 		 456 aa  252  9.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2031  glutamate--ammonia ligase  36.26 
 
 		 451 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.794004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0377  L-glutamine synthetase  36.26 
 
 		 451 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  36.05 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  36.73 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  36.05 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  36.51 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  36.51 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0864  glutamate--putrescine ligase  36.03 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  35.41 
 
 		 445 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1130  glutamate--putrescine ligase  34.44 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  36.51 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  34.97 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  34.2 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  35.19 
 
 		 445 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>