55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3042 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3042  patatin  100 
 
 		 586 aa  1173    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  62.59 
 
 		 321 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0819  alpha-beta hydrolase superfamily esterase  56.38 
 
 		 339 aa  256  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  43.56 
 
 		 339 aa  180  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  38.46 
 
 		 357 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  32.37 
 
 		 363 aa  117  5e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  35.38 
 
 		 343 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  32.14 
 
 		 294 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  30.27 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  31.92 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  29.78 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  29.63 
 
 		 332 aa  67  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  26.07 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  24.39 
 
 		 661 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  26.11 
 
 		 321 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0115  patatin  28.72 
 
 		 285 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0045028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  26.11 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  26.11 
 
 		 321 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  26.11 
 
 		 321 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  26.11 
 
 		 321 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  26.11 
 
 		 321 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  26.11 
 
 		 321 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  26.11 
 
 		 321 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1235  hypothetical protein  46.43 
 
 		 579 aa  61.6  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51530  ExoU  28.08 
 
 		 687 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167383  hitchhiker  0.000105618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  24.89 
 
 		 665 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1235  hypothetical protein  44.64 
 
 		 579 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  27.89 
 
 		 274 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  25.53 
 
 		 284 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  24.4 
 
 		 256 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  24.5 
 
 		 250 aa  51.6  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  21.28 
 
 		 282 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  25.12 
 
 		 923 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  27.32 
 
 		 279 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  28.84 
 
 		 324 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2007  Patatin  27.27 
 
 		 323 aa  48.9  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1449  Patatin  25.09 
 
 		 361 aa  48.9  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  25.97 
 
 		 321 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  24.49 
 
 		 251 aa  48.5  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4272  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1776 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.335477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  26.7 
 
 		 247 aa  47.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2888  hypothetical protein  30.14 
 
 		 615 aa  47.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  24.77 
 
 		 337 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6376  patatin  41.89 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.103764  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  26.09 
 
 		 883 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2071  Patatin  29.02 
 
 		 325 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.157936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  23.5 
 
 		 520 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  27.32 
 
 		 883 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  25.7 
 
 		 318 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  25.7 
 
 		 318 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  27.1 
 
 		 875 aa  43.9  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01713  Patatin family phospholipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08440)  24.48 
 
 		 789 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0885007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  27.69 
 
 		 280 aa  43.9  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  27.46 
 
 		 272 aa  43.9  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  22.77 
 
 		 733 aa  43.5  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>