More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1583 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3550  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  44.33 
 
 		 316 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  37.14 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 201 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 		 591 aa  95.5  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  33.33 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 241 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.32 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.14 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  37.08 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  28.93 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.22 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  34.1 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  28.35 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.48 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0633  Phosphoglycerate mutase  28.52 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.121571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  30.36 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.41 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  27.09 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.64 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  23.39 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  23.08 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  24.71 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  25.71 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  23.7 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  30.95 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  28.74 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  26.59 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.43 
 
 		 382 aa  68.2  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.49 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  31.55 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 370 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  25.57 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  24.31 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  24.31 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.4 
 
 		 442 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  24.31 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  25.64 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  25.5 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  25.5 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.5 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  24.31 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.98 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  25.5 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8706  predicted protein  27.12 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866499  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.61 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  25.5 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  24.43 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  24.31 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  24.31 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  25.44 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.04 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  22.35 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.85 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.85 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>