More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0928 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0928  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
293 aa  586  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.34 
 
 
317 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0294641 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1306  hypothetical protein  64.77 
 
 
401 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319756  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3202  hypothetical protein  59.09 
 
 
415 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.560297  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0440  ATPase-like, ParA/MinD  61.33 
 
 
416 aa  334  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1122  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  59.6 
 
 
471 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.998483  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2300  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.56 
 
 
303 aa  297  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.8116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1408  ParA family protein  52.19 
 
 
295 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.738873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1929  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.12 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.72469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1946  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.62 
 
 
288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1689  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.94 
 
 
308 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0745  MRP family ATPase  48.39 
 
 
285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2027  Mrp protein  49.4 
 
 
285 aa  263  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.251832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3613  ParA family protein  48.31 
 
 
292 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0375479 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1920  ATPase-like, ParA/MinD  46.76 
 
 
296 aa  257  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1956  hypothetical protein  48.02 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000369208  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0621  Mrp protein  45.52 
 
 
301 aa  250  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0268  ATP-binding protein  51.19 
 
 
284 aa  249  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.54861  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2165  ATP-binding protein  48.16 
 
 
269 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1303  hypothetical protein  45.68 
 
 
291 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00503997  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0907  ATP-binding protein  46.1 
 
 
293 aa  246  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.124437  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1967  ATP-binding protein  48.18 
 
 
297 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03090  NBP35, putative  44.25 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.820324  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2615  chromosome partitioning ATPase protein  47.62 
 
 
280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1191  Mrp protein  46.49 
 
 
304 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00197237  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2141  chromosome partitioning ATPase protein  48.28 
 
 
278 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  45.49 
 
 
341 aa  242  5e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  44.56 
 
 
297 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0267  hypothetical protein  45.42 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.950713  normal  0.311122 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1128  hypothetical protein  44.98 
 
 
302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.56 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0533  Mrp protein  42.75 
 
 
272 aa  238  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3361  hypothetical protein  45.21 
 
 
265 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124821  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0731  hypothetical protein  42.66 
 
 
290 aa  236  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1315  hypothetical protein  47.6 
 
 
297 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00797735  hitchhiker  0.00521275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0410  Mrp protein  46.36 
 
 
298 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0473573 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0522  ATPase-like, ParA/MinD  44.7 
 
 
278 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.67 
 
 
270 aa  230  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.677394  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1731  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.35 
 
 
289 aa  229  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.826727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2075  hypothetical protein  47.1 
 
 
298 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.010662  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0180  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.97 
 
 
289 aa  228  7e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0872  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.11 
 
 
289 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.439579  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40400  predicted protein  44.07 
 
 
349 aa  226  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.16 
 
 
289 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.388921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0634  chromosome partitioning ATPase protein  48.58 
 
 
280 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.556056  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0488  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.93 
 
 
287 aa  220  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.89 
 
 
269 aa  219  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38325  nuclear ATPase  42.28 
 
 
330 aa  218  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.879743  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1256  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.61 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0942514  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2173  chromosome partitioning ATPase  40.15 
 
 
302 aa  216  5e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0557  MRP/NBP35 family ATP-binding protein  46.37 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.172221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  46.64 
 
 
347 aa  212  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1200  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.58 
 
 
247 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474173  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  47.62 
 
 
368 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  49.34 
 
 
358 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  44.4 
 
 
358 aa  208  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  44.4 
 
 
358 aa  208  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19821  predicted protein  39.2 
 
 
368 aa  207  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  46.56 
 
 
345 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.31 
 
 
348 aa  206  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  42.8 
 
 
370 aa  206  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  46.53 
 
 
358 aa  205  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  44.4 
 
 
356 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  45.7 
 
 
365 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0908  MRP protein-like  41.73 
 
 
291 aa  203  3e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.382595  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  43.67 
 
 
374 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  45.06 
 
 
363 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  42.8 
 
 
373 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4074  hypothetical protein  44.35 
 
 
336 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  45.82 
 
 
376 aa  201  9e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  44.4 
 
 
361 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1232  hypothetical protein  41.92 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000427617  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.45 
 
 
395 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  43.03 
 
 
382 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1485  hypothetical protein  43.83 
 
 
368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450542  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  46.88 
 
 
351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  44.06 
 
 
305 aa  198  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1211  nucleotide-binding protein  41.67 
 
 
279 aa  198  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000175962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  44.49 
 
 
374 aa  198  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  43.87 
 
 
285 aa  198  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  43.64 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  43.08 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  41.6 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  41.5 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  45.56 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0594  chromosome partitioning ATPase protein-like  50 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00720  nucleotide binding protein, putative  43.46 
 
 
331 aa  196  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.263635  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.52 
 
 
266 aa  196  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.73193  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  41.64 
 
 
364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.44 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  44.72 
 
 
353 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  44.44 
 
 
374 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  44.72 
 
 
353 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1565  protein of unknown function DUF59  48.42 
 
 
354 aa  196  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.226796  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  41.16 
 
 
357 aa  195  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  44.07 
 
 
361 aa  195  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1438  ATPase-like, ParA/MinD  40 
 
 
296 aa  194  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1328  ATPase-like, ParA/MinD  40.82 
 
 
302 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  43.12 
 
 
363 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  43.98 
 
 
365 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>