59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3197 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  236  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  45.22 
 
 		 115 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  41.74 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  46.09 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  40.35 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  40.52 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  33.91 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  36.13 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  31.03 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  33.67 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  25.66 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  31.25 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  35 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  33.05 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  31.36 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  33.06 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  25.86 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  28.69 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  29.06 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  29.03 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  27.97 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  34.45 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  25 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  28.07 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  27.43 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  29.57 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  27.97 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  29.82 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  26.67 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  31.3 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3001  hypothetical protein  29.73 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.51412  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  28.32 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  27.19 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  32.11 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  23.58 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  30.36 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  30.1 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1943  hypothetical protein  28.68 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.862348  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0180  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0526709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  27.97 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  29.63 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  25.89 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  24.19 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  28.45 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1908  hypothetical protein  25.83 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.512123 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  27.13 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0509  hypothetical protein  28.07 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0289752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2758  hypothetical protein  35.45 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1366  putative secreted protein  25.44 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  25.86 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  31.65 
 
 		 152 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  31.76 
 
 		 145 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>