38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3167 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 294 aa  584  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  41.84 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0931  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  28.47 
 
 		 261 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  25.45 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  27.74 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1499  hypothetical protein  39.2 
 
 		 422 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0758513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2215  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 271 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  29.75 
 
 		 704 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1676 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.89 
 
 		 689 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3247  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0393  hypothetical protein  25.86 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 453 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 715 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 762 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1005 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 207 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 870 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  34.62 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.07 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03573  tetratricopeptide repeat family  32.11 
 
 		 690 aa  43.1  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432087  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  32.26 
 
 		 631 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1250  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.13 
 
 		 252 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.901782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0132  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0754  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 453 aa  42.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>