119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2013 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2013  flagellar biosynthesis protein FlhF, putative  100 
 
 
419 aa  833    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0157  flagellar biosynthesis protein FlhF, putative  58.73 
 
 
365 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.585819  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0327  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  51.66 
 
 
347 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.114959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0381  flagellar biosynthesis protein FlhF, putative  51.24 
 
 
362 aa  356  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.896845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3470  flagellar biosynthesis protein FlhF, putative  36.77 
 
 
353 aa  262  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16670  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  25.76 
 
 
356 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2028  flagellar biosynthetic protein FlhF  30.22 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.68 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2152  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  24.72 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2030  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  24.08 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1314  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  30.77 
 
 
402 aa  79  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1508  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.64 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.72 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  28.95 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.1 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.1 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1139  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  29.29 
 
 
626 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1672  GTP-binding signal recognition particle  23.17 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.03 
 
 
551 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.03 
 
 
551 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.11 
 
 
542 aa  67.4  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  20.16 
 
 
378 aa  67  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000398912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  20.16 
 
 
378 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  30.37 
 
 
419 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0486  GTP-binding signal recognition particle  22.59 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.5 
 
 
484 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1411  flagellar biosynthetic protein FlhF  25.94 
 
 
381 aa  63.2  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  28.65 
 
 
466 aa  63.2  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0703  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.26 
 
 
362 aa  62.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  26.5 
 
 
585 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.05 
 
 
452 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0407274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2023  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.38 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  23.64 
 
 
447 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  25.42 
 
 
452 aa  60.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0377  flagellar biosynthesis regulator FlhF  22.05 
 
 
372 aa  60.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0293  flagellar biosynthetic protein FlhF  23.72 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0113568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2694  GTP-binding signal recognition particle  26.59 
 
 
404 aa  60.1  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.38 
 
 
393 aa  59.7  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.79 
 
 
484 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  25.74 
 
 
427 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  20.3 
 
 
395 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0102  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.79 
 
 
484 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1437  flagellar biosynthesis regulator FlhF  20.67 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  25.25 
 
 
441 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.82 
 
 
495 aa  58.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  22.94 
 
 
513 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25 
 
 
458 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00655433  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  26.9 
 
 
437 aa  56.6  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  21.81 
 
 
438 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  26.26 
 
 
505 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2014  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-protein  24.8 
 
 
729 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0074  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.79 
 
 
481 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  25.69 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4343  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.65 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  25.23 
 
 
481 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.26 
 
 
503 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3912  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.65 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.25 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1977  flagellar biosynthesis protein FlhF  28 
 
 
442 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218828  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3039  GTP-binding signal recognition particle  28.33 
 
 
452 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0233  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.75 
 
 
461 aa  54.3  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1524  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.65 
 
 
435 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142564  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1399  GTP-binding signal recognition particle  24.56 
 
 
438 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2838  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.73 
 
 
592 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0269  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.73 
 
 
592 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  24.1 
 
 
446 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1311  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.87 
 
 
570 aa  53.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3372  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.34 
 
 
587 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303605  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  23.71 
 
 
536 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0251  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.83 
 
 
582 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1485  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  23.53 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4142  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.7 
 
 
784 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3439  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.09 
 
 
442 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.85 
 
 
588 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.85 
 
 
588 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.09 
 
 
446 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2686  flagellar biosynthetic protein FlhF  24.88 
 
 
446 aa  50.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.09 
 
 
577 aa  50.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1357  GTP-binding signal recognition particle  26.47 
 
 
378 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3669  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.97 
 
 
435 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421511  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0276  flagellar biosynthesis regulator FlhF  20.88 
 
 
388 aa  50.1  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.88 
 
 
463 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.71 
 
 
632 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.37 
 
 
624 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.71 
 
 
632 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.64 
 
 
583 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.37 
 
 
657 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.64 
 
 
583 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.64 
 
 
583 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.12 
 
 
474 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.25 
 
 
644 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.76 
 
 
374 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.76 
 
 
374 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.76 
 
 
374 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.14 
 
 
615 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  22.25 
 
 
825 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.79 
 
 
467 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.77 
 
 
429 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.02 
 
 
804 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  25.58 
 
 
464 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.03242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>