177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1322 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1322  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 
136 aa  271  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198104 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0472  hypothetical protein  50.77 
 
 
125 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0366232 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2958  flagellar basal-body rod protein, putative  45.38 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3229  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.06 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1767  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.88 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0268  flagellar basal body rod protein FlgG  55.56 
 
 
261 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3366  flagellar basal body rod protein FlgG  55.56 
 
 
261 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  30.47 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  41.54 
 
 
261 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000735  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.54 
 
 
243 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  43.4 
 
 
261 aa  47.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.89 
 
 
261 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  38.57 
 
 
262 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  38.57 
 
 
262 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  38.57 
 
 
262 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  38.46 
 
 
527 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  53.33 
 
 
262 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  50 
 
 
261 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  52.5 
 
 
261 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.48 
 
 
261 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.5 
 
 
261 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.5 
 
 
261 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  55 
 
 
261 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.5 
 
 
261 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  55 
 
 
261 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  46.34 
 
 
262 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  50 
 
 
265 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  44.44 
 
 
262 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  46.34 
 
 
496 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  47.62 
 
 
262 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  44.44 
 
 
262 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2264  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.82 
 
 
262 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.67 
 
 
261 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.67 
 
 
261 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  42.22 
 
 
261 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  41.51 
 
 
420 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  39.13 
 
 
405 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  48.78 
 
 
262 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  39.13 
 
 
425 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  45.65 
 
 
247 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 
262 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  39.13 
 
 
404 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.3 
 
 
423 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  26.95 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  43.48 
 
 
413 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.74 
 
 
545 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  40 
 
 
261 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  32.61 
 
 
462 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3830  hypothetical protein  42.86 
 
 
538 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0390801  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1601  flagellar basal body rod protein FlgF  40.82 
 
 
247 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  37.93 
 
 
247 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3103  flagellar basal body FlaE domain protein  42.86 
 
 
531 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  37.78 
 
 
262 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01291  flagellar basal body rod protein FlgF  40.43 
 
 
249 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  36.96 
 
 
408 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  44.44 
 
 
247 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  42 
 
 
260 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  37.78 
 
 
402 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1156  flagellar basal body rod protein FlgG  40 
 
 
261 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  40.48 
 
 
398 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.61 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2912  flagellar basal body rod protein FlgG  42.22 
 
 
261 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.157817  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 
432 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  47.5 
 
 
261 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  35.38 
 
 
262 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.22 
 
 
261 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  42.5 
 
 
461 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50430  flagellar basal body rod protein FlgG  42.22 
 
 
261 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.55 
 
 
263 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  32.76 
 
 
564 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.94 
 
 
426 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  47.5 
 
 
261 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.11 
 
 
562 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 
433 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  37.78 
 
 
402 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0911  putative flagellar basal-body rod protein (flgC)  45.45 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1420  flagellar basal body rod protein FlgF  37.93 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4295  flagellar basal body rod protein FlgG  42.22 
 
 
261 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.18 
 
 
294 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0335903 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  37.93 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  40.48 
 
 
399 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3096  flagellar basal body rod protein FlgF  37.93 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.827797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  34.04 
 
 
401 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  34.04 
 
 
402 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2091  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.34 
 
 
499 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0508836  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  34.04 
 
 
402 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  42.55 
 
 
417 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1667  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.91 
 
 
262 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431879  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  34.04 
 
 
401 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  38.78 
 
 
262 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  34.04 
 
 
401 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  37.78 
 
 
401 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  34.04 
 
 
401 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  40 
 
 
261 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  42.22 
 
 
262 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  44.44 
 
 
247 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  46.34 
 
 
418 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  34.04 
 
 
402 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  28.46 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  34.04 
 
 
402 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>