More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000735 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000735  flagellar basal-body rod protein FlgG  100 
 
 
243 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  97.12 
 
 
261 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3573  flagellar basal-body rod protein FlgG  69.83 
 
 
261 aa  358  6e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  65.84 
 
 
261 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  65.43 
 
 
261 aa  332  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  65.02 
 
 
261 aa  332  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  64.61 
 
 
261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  64.61 
 
 
261 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0222  flagellar basal body rod protein FlgG  65.84 
 
 
261 aa  322  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0644  flagellar basal body rod protein FlgG  65.84 
 
 
261 aa  322  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  64.61 
 
 
261 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0189  flagellar basal body rod protein FlgG  62.81 
 
 
262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0242  flagellar basal body rod protein FlgG  62.81 
 
 
262 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3366  flagellar basal body rod protein FlgG  57.61 
 
 
261 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  60.49 
 
 
261 aa  295  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0268  flagellar basal body rod protein FlgG  57.61 
 
 
261 aa  295  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  57.2 
 
 
261 aa  289  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  60.08 
 
 
262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  59.26 
 
 
261 aa  286  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4295  flagellar basal body rod protein FlgG  58.44 
 
 
261 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50430  flagellar basal body rod protein FlgG  58.44 
 
 
261 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  58.85 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  57.61 
 
 
261 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  58.02 
 
 
261 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  57.2 
 
 
261 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4676  flagellar basal body rod protein FlgG  57.02 
 
 
261 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  55.97 
 
 
261 aa  276  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  56.15 
 
 
262 aa  269  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  56.56 
 
 
262 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  53.91 
 
 
262 aa  267  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  54.36 
 
 
260 aa  264  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1326  hypothetical protein  55.19 
 
 
260 aa  263  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.32 
 
 
261 aa  263  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.04 
 
 
260 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.04 
 
 
260 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0754  flagellar basal body rod protein FlgG  56.3 
 
 
260 aa  260  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.94 
 
 
260 aa  258  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  54.32 
 
 
263 aa  255  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  52.5 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  52.5 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  51.44 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  53.11 
 
 
262 aa  252  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  53.11 
 
 
262 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0515  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.03 
 
 
261 aa  253  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.308837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.89 
 
 
262 aa  251  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004168  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.87 
 
 
262 aa  251  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  52.7 
 
 
262 aa  251  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2333  flagellar basal body rod protein FlgG  53.28 
 
 
262 aa  248  7e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01292  flagellar basal body rod protein FlgG  52.05 
 
 
262 aa  247  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.04 
 
 
260 aa  245  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.04 
 
 
260 aa  245  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1632  flagellar basal body rod protein FlgG  49.38 
 
 
260 aa  244  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.865397  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.16 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2912  flagellar basal body rod protein FlgG  52.26 
 
 
261 aa  243  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.157817  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1787  flagellar basal body rod protein FlgG  52.87 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  50.62 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  50.62 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  51.04 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.83 
 
 
261 aa  242  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.1 
 
 
262 aa  241  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.96 
 
 
260 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3349  flagellar basal body rod protein FlgG  51.45 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  51.45 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2094  flagellar basal body rod protein FlgG  51.45 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  51.45 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4194  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.55 
 
 
260 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2999  flagellar basal body rod protein FlgG  51.45 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2965  flagellar basal body rod protein FlgG  51.04 
 
 
260 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22311  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  51.45 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  51.45 
 
 
262 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  52.28 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.87 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.94 
 
 
263 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0245  flagellar basal body rod protein FlgG  51.04 
 
 
262 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3578  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.79 
 
 
261 aa  238  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01074  flagellar component of cell-distal portion of basal-body rod  49.38 
 
 
260 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2568  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.38 
 
 
260 aa  238  8e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.147669  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1201  flagellar basal body rod protein FlgG  49.38 
 
 
260 aa  238  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1457  flagellar basal body rod protein FlgG  49.38 
 
 
260 aa  238  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01082  hypothetical protein  49.38 
 
 
260 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2050  flagellar basal body rod protein FlgG  49.38 
 
 
260 aa  238  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.128751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1959  flagellar basal-body rod FlgG  50.83 
 
 
261 aa  238  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  47.74 
 
 
261 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  47.74 
 
 
261 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.58 
 
 
260 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1291  flagellar basal body rod protein FlgG  49.38 
 
 
260 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0160889 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1482  flagellar basal body rod protein FlgG  48.36 
 
 
262 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.655215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2522  flagellar basal body rod protein FlgG  48.96 
 
 
260 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2009  flagellar basal body rod protein FlgG  49.38 
 
 
260 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0403939  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1276  flagellar basal body rod protein FlgG  49.38 
 
 
260 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.656039  hitchhiker  0.0035938 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.21 
 
 
261 aa  236  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1592  flagellar basal body rod protein FlgG  48.55 
 
 
260 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1201  flagellar basal body rod protein FlgG  48.96 
 
 
260 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1247  flagellar basal body rod protein FlgG  49.38 
 
 
260 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.241133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1266  flagellar basal body rod protein FlgG  48.97 
 
 
262 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17083  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3015  flagellar basal body rod protein FlgG  50.21 
 
 
262 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6366  flagellar basal body rod protein FlgG  50.62 
 
 
262 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  50.21 
 
 
261 aa  235  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  48.96 
 
 
260 aa  235  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  49.38 
 
 
260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>