90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0001 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0022  tRNA-Leu  89.77 
 
 		 87 bp  87.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0224187  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0086  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 83 bp  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208986  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0126  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177569  hitchhiker  0.000589421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  85.88 
 
 		 83 bp  60  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  86.57 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0004  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00803834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0017  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.777785  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 84 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0030  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  86.11 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  86.76 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0036  tRNA-Leu  85.29 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0050  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000197413  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5663  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0298  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000067681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5671  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000115086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5045  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000280343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0276  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0056  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.756385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00430  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366056  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0029  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0069  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649401 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1359  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.331656  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0092  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  hitchhiker  0.00311227 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610285  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.167819  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0021  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0001  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0047  tRNA-Leu  87.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.665018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639768  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309141  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616897  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0018  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0115557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0946  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1054  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0011771  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0041  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309164  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309090  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0035  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438975  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0001  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>