38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0021 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0021  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0029  tRNA-Pro  91.03 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0022  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0010  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000189735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0089  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.62711e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0041  tRNA-Pro  85.53 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.83752 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0020  tRNA-Pro  93.02 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130246  normal  0.018662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0026  tRNA-Pro  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.094878  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  93.02 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt25  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0023  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0022  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000445739  unclonable  9.38504e-19 
 
 
-
 
NC_006369  lplt25  tRNA-Pro  84.62 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0035  tRNA-Pro  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1378  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0056  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0016  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0045  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0031  tRNA-Pro  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000153307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0066  tRNA-Pro  84.51 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000715268  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0031  tRNA-Pro  88.37 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000674228  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0680  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0731401  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0026  tRNA-Pro  89.13 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0040  tRNA-Pro  82.05 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181284  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0016  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0018  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.767214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0126  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177569  hitchhiker  0.000589421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0785  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.571174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0030  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>