More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1541 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1541  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 494 aa  981    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2318  AMP-dependent synthetase and ligase  98.58 
 
 		 494 aa  968    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  63.13 
 
 		 506 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  47.29 
 
 		 487 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1049  AMP-dependent synthetase and ligase  40.57 
 
 		 495 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  34.64 
 
 		 487 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  34.64 
 
 		 487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  34.08 
 
 		 487 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  34.44 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  34.17 
 
 		 559 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  33.8 
 
 		 487 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  34.17 
 
 		 559 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  34.25 
 
 		 559 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  34.25 
 
 		 487 aa  211  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 487 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 468 aa  180  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 498 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  26.25 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2026  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.55 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  32.11 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 490 aa  134  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4137  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 554 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 545 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  29.56 
 
 		 560 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 585 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 583 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1008  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 472 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.75 
 
 		 537 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  28.93 
 
 		 577 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  26.14 
 
 		 553 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  28.93 
 
 		 577 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 549 aa  121  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  28.93 
 
 		 574 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 551 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.7 
 
 		 514 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  22.39 
 
 		 458 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0598  AMP-dependent synthetase and ligase  22.39 
 
 		 458 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  30.13 
 
 		 564 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 		 571 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 		 511 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 		 561 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 527 aa  117  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  30 
 
 		 517 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 519 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 565 aa  116  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  27.81 
 
 		 534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  28.98 
 
 		 569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 517 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  26.67 
 
 		 560 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3099  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 513 aa  115  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000841335 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 		 527 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  26.16 
 
 		 544 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 504 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5455  hypothetical protein  28.46 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.93 
 
 		 519 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  27 
 
 		 526 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  27.25 
 
 		 511 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  26.88 
 
 		 515 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0867  putative AMP-dependent synthetase and ligase  30.03 
 
 		 543 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  29.3 
 
 		 2350 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.36 
 
 		 501 aa  113  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  25.15 
 
 		 549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  25.65 
 
 		 565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  26.88 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.33 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  26.88 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.81 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  29.44 
 
 		 520 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 535 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  27.46 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 		 630 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  25.07 
 
 		 537 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2354  putative acetyl-CoA synthetase  27.57 
 
 		 511 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.804997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  25.94 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>