More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4138 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
330 aa  680    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  66.57 
 
 
362 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.99 
 
 
352 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.2 
 
 
318 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.38 
 
 
342 aa  436  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.06 
 
 
322 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.29 
 
 
323 aa  431  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.06 
 
 
322 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.75 
 
 
322 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.44 
 
 
322 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.44 
 
 
322 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.44 
 
 
322 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.64 
 
 
323 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.81 
 
 
322 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.69 
 
 
357 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.24 
 
 
342 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.17 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.8 
 
 
358 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.79 
 
 
358 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.9 
 
 
359 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.76 
 
 
355 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.83 
 
 
348 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.94 
 
 
356 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.88 
 
 
341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.38 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.72 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.23 
 
 
352 aa  404  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.52 
 
 
336 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.51 
 
 
337 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.52 
 
 
336 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0482  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.65 
 
 
349 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0600  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.65 
 
 
349 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0365968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.32 
 
 
327 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.87 
 
 
329 aa  391  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 
336 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.52 
 
 
336 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.02 
 
 
340 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.14 
 
 
351 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.41 
 
 
341 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.19 
 
 
318 aa  386  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.67 
 
 
340 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1350  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.95 
 
 
363 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.505877  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.82 
 
 
354 aa  378  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 
354 aa  378  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.93 
 
 
356 aa  378  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.449381  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.61 
 
 
350 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.35 
 
 
362 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.34 
 
 
351 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.81 
 
 
355 aa  378  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.43 
 
 
357 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.27 
 
 
351 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55 
 
 
318 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60 
 
 
323 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.82 
 
 
349 aa  376  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.29 
 
 
357 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1005  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.31 
 
 
355 aa  374  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.610294  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 
354 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.62 
 
 
340 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.15 
 
 
339 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.23 
 
 
355 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.8 
 
 
356 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.97 
 
 
348 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1136  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  61.85 
 
 
360 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0311464 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.08 
 
 
344 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.29 
 
 
353 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.63 
 
 
350 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2291  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.99 
 
 
349 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.494545  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.93 
 
 
355 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.46 
 
 
355 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1797  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.45 
 
 
338 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.02 
 
 
354 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.83 
 
 
320 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1995  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.29 
 
 
357 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.10362  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.64 
 
 
356 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.72 
 
 
367 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.41 
 
 
350 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.05 
 
 
355 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5840  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.21 
 
 
352 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.481427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.25 
 
 
351 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55 
 
 
350 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.94 
 
 
354 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1889  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.12 
 
 
345 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0868281  hitchhiker  0.00930049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.16 
 
 
353 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.31 
 
 
323 aa  364  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.58 
 
 
337 aa  363  2e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.18378  hitchhiker  0.0000000578516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 
351 aa  363  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1778  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 
349 aa  363  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00040311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.16 
 
 
355 aa  363  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55 
 
 
360 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.73 
 
 
354 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.20541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.79 
 
 
355 aa  363  3e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3727  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.71 
 
 
353 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1714  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.71 
 
 
353 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.41 
 
 
364 aa  362  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0761  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.12 
 
 
353 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55 
 
 
353 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55 
 
 
353 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.41 
 
 
353 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4019  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.09 
 
 
352 aa  362  6e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  53.06 
 
 
354 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>