More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3517 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3517  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit X  100 
 
 		 335 aa  682    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0179  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  90.03 
 
 		 332 aa  578  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2036  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  82.18 
 
 		 333 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128879  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0262  chlorophyllide reductase, BchX subunit  82.48 
 
 		 333 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1906  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  82.48 
 
 		 333 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195312  normal  0.342059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3756  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.7 
 
 		 332 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4001  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.7 
 
 		 332 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  hitchhiker  0.00239808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1293  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  79.62 
 
 		 331 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1710  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  76.2 
 
 		 332 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6437  bacteriochlorophyllide reductase subunit  73.87 
 
 		 332 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2730  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  74.63 
 
 		 334 aa  454  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2957  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  74.63 
 
 		 334 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562644  normal  0.106043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2980  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  74.45 
 
 		 322 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551452  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2852  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  77.74 
 
 		 334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.467181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2052  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  76.49 
 
 		 329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0401365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2818  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  77.57 
 
 		 334 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292291  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1610  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  73.36 
 
 		 308 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3697  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  74.38 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3746  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  41.99 
 
 		 392 aa  236  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0605815  hitchhiker  0.0000012212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3260  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  42.31 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0937  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.9 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3127  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  48.48 
 
 		 411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0897  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.43 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0400  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.13 
 
 		 369 aa  230  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0534457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1792  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.84 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.344281  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1535  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.49 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292172  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0979  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  44.03 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1423  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.84 
 
 		 366 aa  226  6e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.27 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  41.28 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  42.04 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  38.75 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  37.45 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  40.6 
 
 		 731 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  38.58 
 
 		 272 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  35.86 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  37.96 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  37.08 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  37.1 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  40.09 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  44.05 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  39.65 
 
 		 274 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  39.56 
 
 		 273 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  39.61 
 
 		 270 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  36.3 
 
 		 276 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  37 
 
 		 274 aa  162  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  35.88 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  41.94 
 
 		 251 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  38.72 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  42.04 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  39.82 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  36.8 
 
 		 291 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  47.28 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  41.97 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  35.45 
 
 		 275 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  39.38 
 
 		 274 aa  159  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  38.94 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  39.35 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.91 
 
 		 296 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  39.35 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  35.47 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  37.02 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  34.41 
 
 		 313 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  35.53 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  39.39 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  38.96 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  35.19 
 
 		 292 aa  156  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  37.64 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  34.81 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  38.94 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  33.82 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  33.45 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  35.96 
 
 		 275 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  38.5 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.91 
 
 		 268 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  35.69 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  34.81 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  34.94 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  35.47 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  36.13 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  36.82 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  35.21 
 
 		 275 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4930  nitrogenase reductase  39.73 
 
 		 295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  36.26 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  37.79 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  43.75 
 
 		 248 aa  153  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  35.58 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  34.55 
 
 		 292 aa  153  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  40.57 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1010  nitrogenase reductase  34.75 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  37.39 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  38.37 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  36.63 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  35.79 
 
 		 299 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1007  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  36.46 
 
 		 297 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.474133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  36.06 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  35.19 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5052  nitrogenase reductase  39.56 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  35.32 
 
 		 296 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  35.19 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>