246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2677 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  100 
 
 
233 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  64.88 
 
 
208 aa  258  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  64.88 
 
 
208 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  64.53 
 
 
211 aa  257  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  56.64 
 
 
228 aa  236  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  52.53 
 
 
225 aa  205  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  53.44 
 
 
204 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  54.69 
 
 
201 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.83 
 
 
211 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  44.93 
 
 
240 aa  175  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  48.19 
 
 
202 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  50 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  50 
 
 
226 aa  168  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  48.15 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.59 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  44.06 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  45.6 
 
 
213 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  43.52 
 
 
213 aa  161  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  44.97 
 
 
216 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  44.44 
 
 
218 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.65 
 
 
226 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  43.17 
 
 
239 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  44.44 
 
 
216 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0520  GDSL family lipase  46.28 
 
 
212 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  44.97 
 
 
251 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  44.26 
 
 
241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  44.26 
 
 
241 aa  151  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  45.99 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  43.96 
 
 
198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  43.52 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  44.81 
 
 
248 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  42.79 
 
 
214 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  48.91 
 
 
240 aa  144  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  46.28 
 
 
223 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.45 
 
 
227 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  40.5 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  44.44 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  45.51 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  45.3 
 
 
214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.39 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  38.62 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  37.22 
 
 
223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  41.62 
 
 
255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  37.22 
 
 
223 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  39.06 
 
 
188 aa  118  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  39.46 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  36.07 
 
 
266 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  42.02 
 
 
204 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  39.36 
 
 
216 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  38.92 
 
 
205 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.7 
 
 
237 aa  115  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  32.86 
 
 
209 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2403  arylesterase  35.5 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  40.8 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  37.97 
 
 
219 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  36.6 
 
 
195 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1242  GDSL family lipase  38.31 
 
 
213 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189658  normal  0.178592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  39.01 
 
 
201 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  39.01 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  34.01 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  36.17 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  34.92 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  36.41 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  36.7 
 
 
205 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  35.05 
 
 
202 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  36.56 
 
 
201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  36.65 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  39.77 
 
 
208 aa  108  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0267  lipolytic protein G-D-S-L family  38.21 
 
 
215 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  36.22 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1888  GDSL family lipase  36.02 
 
 
205 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172385  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  33.48 
 
 
224 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  36.65 
 
 
226 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  39.38 
 
 
192 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.02 
 
 
270 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  36.96 
 
 
209 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  36.19 
 
 
198 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  35.79 
 
 
184 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  34.69 
 
 
190 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  34.5 
 
 
208 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  36.65 
 
 
226 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  36.65 
 
 
226 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  36.65 
 
 
232 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  37.38 
 
 
201 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  36.65 
 
 
226 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  36.65 
 
 
210 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  36.65 
 
 
210 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04660  acyl-CoA thioesterase I  32.99 
 
 
217 aa  105  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0171424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  36.26 
 
 
201 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  34.62 
 
 
214 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  35.35 
 
 
222 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  37.82 
 
 
212 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  34.54 
 
 
215 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  35.12 
 
 
208 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  35.35 
 
 
222 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1485  arylesterase  37.57 
 
 
195 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  32.99 
 
 
270 aa  103  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  38.2 
 
 
249 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  38.46 
 
 
199 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  36.26 
 
 
201 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>