57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1398 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  100 
 
 		 150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  52.67 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  48.63 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  48.65 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  39.63 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  42.58 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  44.93 
 
 		 154 aa  105  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  46.67 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  37.4 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  37.4 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  36.84 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  42.74 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  36.13 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  40.32 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  31.97 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  35.48 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  36.09 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  36.09 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  32.82 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  33.11 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  31.61 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  36.29 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  32.8 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  34.43 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  29.69 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  26.83 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0173  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.129014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  30.67 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  32.79 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  32.67 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  29.55 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  26.28 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  28.67 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  24.05 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  29 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  31 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  26.83 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  30.1 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  29.7 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  32.5 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  27.78 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  26.67 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3049  hypothetical protein  28.47 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1843  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  35.71 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0056  hypothetical protein  32.99 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  26.32 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  28.03 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  30.95 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3213  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2493  hypothetical protein  27.64 
 
 		 174 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256462  normal  0.792033 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  22.79 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  27.47 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1515  hypothetical protein  25.93 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3212  hypothetical protein  25 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  25 
 
 		 116 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>