175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0352 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0352  acetyltransferase  100 
 
 
177 aa  361  4e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0753  acetyltransferase  53.8 
 
 
172 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0755  acetyltransferase  48.28 
 
 
175 aa  165  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0754  GCN5-related N-acetyltransferase  46.63 
 
 
179 aa  143  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  45.73 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332564  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1051  hypothetical protein  48.47 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2712  GCN5-related N-acetyltransferase  48.47 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.757846  normal  0.0335255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  46.99 
 
 
176 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0350  hypothetical protein  39.88 
 
 
201 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2605  hypothetical protein  37.79 
 
 
201 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.463816  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0752  GCN5-related N-acetyltransferase  43.27 
 
 
170 aa  114  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  39.26 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.988966  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
169 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0346868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1052  acetyltransferase  37.8 
 
 
178 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1058  hypothetical protein  37.93 
 
 
166 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2713  putative acetyltransferase  37.8 
 
 
178 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.699108  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0317  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0177  acetyltransferase  34.13 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
180 aa  95.5  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  37.16 
 
 
207 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1050  acetyltransferase  40.12 
 
 
186 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 
181 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0751  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
164 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0179  GCN5-related N-acetyltransferase  39.52 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  36.3 
 
 
194 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1431  acetyltransferase  37.5 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  34.04 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2711  GCN5-related N-acetyltransferase  38.92 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.764957  normal  0.0336934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  35.81 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0037  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  28.39 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  28.31 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  29.38 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3625  hypothetical protein  30.2 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0249063  normal  0.199157 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3255  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
165 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  28.57 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
165 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
165 aa  57.8  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03674  Acetyltransferase, including N-acetylase of ribosomal protein  24.85 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  29.03 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1193  acetyltransferase  29.44 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1115  acetyltransferase  29.44 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0671  acetyltransferase  28.89 
 
 
204 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0794  acetyltransferase  28.89 
 
 
204 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2397  acetyltransferase  29.89 
 
 
336 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1758  acetyltransferase  28.89 
 
 
225 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  28.95 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
189 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
189 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  28.39 
 
 
196 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0445  hypothetical protein  22.43 
 
 
169 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  26.03 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1047  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189696  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.630016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.249566 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  23.65 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1419  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
180 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05693  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.04 
 
 
169 aa  51.2  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.65 
 
 
175 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  22.6 
 
 
201 aa  51.2  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
186 aa  50.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5564  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
191 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  30.06 
 
 
192 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  23.65 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6644  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 
191 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  23.65 
 
 
175 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  22.97 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  23.65 
 
 
175 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>