More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2241 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
434 aa  885    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.69767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.05 
 
 
437 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  60.39 
 
 
426 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0463  dihydroorotase, multifunctional complex type  61.61 
 
 
422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0936737 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1870  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.9 
 
 
420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1426  dihydroorotase, multifunctional complex type  62.2 
 
 
426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.26 
 
 
434 aa  341  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.74 
 
 
425 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  43.6 
 
 
425 aa  326  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.15 
 
 
441 aa  323  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.06 
 
 
429 aa  322  6e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.89 
 
 
429 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.86 
 
 
425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.56 
 
 
424 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  43.65 
 
 
422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.2 
 
 
436 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.48 
 
 
424 aa  316  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.49 
 
 
430 aa  316  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.61 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.62 
 
 
425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  41.88 
 
 
426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  42.26 
 
 
427 aa  312  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.72 
 
 
425 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  42.26 
 
 
436 aa  308  9e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.99 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.16 
 
 
427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  39.09 
 
 
426 aa  305  8.000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.67 
 
 
434 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.3 
 
 
434 aa  299  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.91 
 
 
429 aa  297  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  42.01 
 
 
428 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  37.84 
 
 
426 aa  294  2e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  39.01 
 
 
431 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  40.89 
 
 
430 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 
435 aa  290  3e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.22 
 
 
433 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  41.08 
 
 
429 aa  288  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  43.48 
 
 
433 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.95 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  41.24 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  41.4 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.16 
 
 
439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.45 
 
 
432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  41.35 
 
 
458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  40.52 
 
 
423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  41.22 
 
 
431 aa  282  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.41 
 
 
433 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.36 
 
 
425 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.05 
 
 
442 aa  279  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  36.3 
 
 
425 aa  278  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.21 
 
 
430 aa  277  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  41.51 
 
 
432 aa  276  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  41.93 
 
 
435 aa  276  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  44.53 
 
 
433 aa  275  8e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  42.41 
 
 
428 aa  275  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  40.37 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  41.9 
 
 
462 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  42.6 
 
 
433 aa  273  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  40.31 
 
 
451 aa  273  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  43.48 
 
 
431 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  41.34 
 
 
425 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.59 
 
 
473 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  39.62 
 
 
449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  41.2 
 
 
430 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  40.52 
 
 
431 aa  270  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.71 
 
 
429 aa  270  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  37.5 
 
 
425 aa  269  7e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.32 
 
 
433 aa  269  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  40.59 
 
 
425 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.11 
 
 
437 aa  266  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  39.58 
 
 
448 aa  264  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  40.43 
 
 
428 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.25 
 
 
428 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  40.67 
 
 
446 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  39.6 
 
 
428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.49 
 
 
433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  40.73 
 
 
427 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  39.59 
 
 
431 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.94 
 
 
448 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  40.33 
 
 
432 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  39.59 
 
 
431 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  39.59 
 
 
431 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  43.26 
 
 
427 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  42.3 
 
 
430 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  35.68 
 
 
425 aa  257  3e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  36.03 
 
 
425 aa  257  4e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.19 
 
 
437 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.15 
 
 
497 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.7 
 
 
428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  40.56 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  41.45 
 
 
440 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.21 
 
 
497 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.25 
 
 
426 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.62 
 
 
430 aa  253  5.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.69 
 
 
431 aa  252  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  36.96 
 
 
428 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.59 
 
 
427 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  35.22 
 
 
459 aa  250  4e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  38.04 
 
 
459 aa  249  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  37.14 
 
 
433 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>