224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1049 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 		 269 aa  95.9  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  33.21 
 
 		 267 aa  95.5  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  31.66 
 
 		 267 aa  89.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 278 aa  89  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  30.23 
 
 		 268 aa  89  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  30.86 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  28.74 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  31.35 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  29.18 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  27.68 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  29.72 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  29.2 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  26.46 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  29.01 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  29.01 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  29.72 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  28.8 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  29.7 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  26.59 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  29.2 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  30.62 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  22.83 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  23.26 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  28.92 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  28 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  28.46 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  34.21 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  33.12 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  25.5 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  26.55 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  31.95 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  28.08 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  19.84 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  25.09 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  34.59 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  29.2 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  30.47 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  29.58 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  25.63 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  31.21 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  26.91 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  29.96 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  29.58 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  25.67 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  23.6 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  29.11 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  29.11 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  29.11 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  29.11 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  27.41 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  29.6 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  29.11 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  29.11 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  29.11 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  30.73 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  29.07 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  30.88 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  27.09 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  30.73 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  25.97 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0081  biotin biosynthesis protein BioC  31.13 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  26.69 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0084  putative biotin synthesis protein  24.5 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  25.67 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18701  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.04 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  26.27 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  29.3 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  30.1 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  26.69 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  24.44 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1001  SAM dependent methyltransferase  24.04 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  29.9 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  25.82 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  24.44 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  27.97 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  28.03 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  23.7 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  23.7 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  23.7 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  23.7 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  23.7 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  26.67 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  22.22 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15901  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.43 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  24.53 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 397 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  24.55 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>