283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0582 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0582  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 		 109 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  69.32 
 
 		 103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3438  flagellar motor switch protein FliN  67.44 
 
 		 99 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  64.52 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  64.52 
 
 		 101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  66.67 
 
 		 99 aa  123  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4201  flagellar motor switch protein FliN  62.79 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  66.67 
 
 		 170 aa  120  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  66.27 
 
 		 190 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  64.77 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  63.64 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  63.64 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  64.29 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3826  flagellar motor switch protein FliN  63.1 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3910  flagellar motor switch protein FliN  63.1 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  63.86 
 
 		 188 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  65.06 
 
 		 180 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  66.25 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  55.91 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  62.79 
 
 		 152 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  60.44 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  63.86 
 
 		 154 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  62.79 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  63.86 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  62.79 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  61.45 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  55.79 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  59.34 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  63.86 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  58.89 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  63.86 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  55.43 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  55.43 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  58.33 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  63.86 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  63.86 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  57.14 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  45.19 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  58.24 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  55.43 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  57.95 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  55.95 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  56.18 
 
 		 226 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  55.95 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  55.95 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  60.24 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  57.14 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  57.32 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  54.12 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  61.45 
 
 		 203 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  55.95 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  61.45 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  61.45 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  55.95 
 
 		 156 aa  106  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  60.24 
 
 		 393 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  56.47 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  56.18 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  57.14 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  56.1 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  56.47 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  58.54 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  58.54 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  52.34 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  56.47 
 
 		 163 aa  104  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.5679 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  46.15 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  52.38 
 
 		 162 aa  103  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  52.38 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  51.76 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  51.09 
 
 		 175 aa  103  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  52.38 
 
 		 162 aa  103  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  52.38 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  52.38 
 
 		 162 aa  103  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  52.38 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  54.65 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  55.81 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  54.65 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  42.11 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  57.32 
 
 		 417 aa  103  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  47.71 
 
 		 138 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  55.81 
 
 		 372 aa  103  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  47.71 
 
 		 138 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  55.95 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  55.95 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  55.95 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  55.95 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  55.95 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  48.35 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  55.95 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  48.35 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  55.95 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  55.95 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  55.95 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>