More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2970 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2970  histidine kinase  100 
 
 		 386 aa  794    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2301  histidine kinase  49.22 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229596 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0902  histidine kinase  47.99 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000164355  hitchhiker  0.00000000561176 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1375  histidine kinase  43.63 
 
 		 447 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2189  sensor histidine kinase  43.65 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0278  histidine kinase  44.62 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.284649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1890  histidine kinase  43.73 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00251613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 377 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2053  histidine kinase  41.98 
 
 		 391 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2728  histidine kinase  41.91 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1412  histidine kinase  40.16 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3006  histidine kinase  37.87 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2287  histidine kinase  40.27 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000635078  normal  0.170007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3366  histidine kinase  36.73 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0880  histidine kinase  35.66 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1696  histidine kinase  33.6 
 
 		 380 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0566842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2934  histidine kinase  37.67 
 
 		 390 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3335  histidine kinase  35.98 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248975  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  27 
 
 		 593 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 1171 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.16 
 
 		 925 aa  70.1  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 589 aa  70.1  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 		 613 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 608 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  hitchhiker  0.000174254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 723 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.64 
 
 		 607 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 634 aa  66.2  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  25.83 
 
 		 592 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1753  sensor protein LuxQ  25.74 
 
 		 583 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 		 781 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  26.13 
 
 		 1185 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 		 627 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  27.08 
 
 		 952 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0636  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318643  normal  0.125988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3182  ATP-binding region ATPase domain protein  22.9 
 
 		 705 aa  63.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 859 aa  63.2  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 632 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  30.48 
 
 		 1347 aa  62.8  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 		 643 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.475252  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  29.81 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 557 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2798  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  25.51 
 
 		 949 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 		 846 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  26.97 
 
 		 1032 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1754  bacteriophytochrome  29.02 
 
 		 538 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478191  normal  0.160792 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  26.97 
 
 		 988 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  26.97 
 
 		 1014 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  26.13 
 
 		 1147 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 830 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  25.85 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  29.89 
 
 		 594 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.44 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  23.9 
 
 		 1689 aa  60.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  27.62 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2671  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.65 
 
 		 841 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0431  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 664 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.44 
 
 		 874 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  25.95 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 1003 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  26.61 
 
 		 835 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  27.9 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  24.47 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.67 
 
 		 1002 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.35 
 
 		 1074 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 640 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3910  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 		 850 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.302032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24 
 
 		 643 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  23.6 
 
 		 651 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 		 770 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  26.81 
 
 		 949 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 		 1195 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  26.45 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 		 1433 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2870  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267269  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  28.76 
 
 		 1150 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.76 
 
 		 768 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  23.2 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 897 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 652 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 638 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2460  histidine kinase  24.8 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  26.45 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  34.58 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2145  histidine kinase  32.74 
 
 		 610 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  25.68 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 770 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.55 
 
 		 643 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2086  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.45 
 
 		 909 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  27.62 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 952 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>