177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1879 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1879  aluminium resistance family protein  100 
 
 
413 aa  840    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000283572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2133  Aluminium resistance family protein  66.5 
 
 
415 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.821926  normal  0.0213182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0558  aluminium resistance family protein  65.27 
 
 
433 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1920  Aluminium resistance family protein  62.16 
 
 
417 aa  508  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1233  Aluminium resistance family protein  54.63 
 
 
422 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0794  aluminium resistance protein  55.15 
 
 
430 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2115  Aluminium resistance family protein  55.61 
 
 
423 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2383  aluminium resistance family protein  53.64 
 
 
423 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.187803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0594  Aluminium resistance family protein  54.17 
 
 
428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000910019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0874  hypothetical protein  53.47 
 
 
412 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3733  hypothetical protein  52.61 
 
 
423 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3551  hypothetical protein  53.4 
 
 
423 aa  461  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3451  aluminum resistance protein  53.4 
 
 
423 aa  461  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3464  aluminum resistance protein  53.65 
 
 
423 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3715  aluminum resistance protein  53.4 
 
 
423 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2242200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3805  aluminum resistance protein  52.61 
 
 
423 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3835  hypothetical protein  53.4 
 
 
423 aa  461  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1500  aluminum resistance protein  52.81 
 
 
423 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0198374 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3756  aluminum resistance protein  53.65 
 
 
423 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00841285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3471  aluminium resistance family protein  52.59 
 
 
423 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0016496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2723  Aluminium resistance family protein  54.14 
 
 
420 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.839574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1618  aluminium resistance family protein  53.77 
 
 
424 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0222221  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1366  hypothetical protein  52.71 
 
 
412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1392  hypothetical protein  52.71 
 
 
412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2378  aluminium resistance family protein  51.91 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00133186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4213  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  52 
 
 
409 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.226781  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2562  aluminum resistance protein-like  53.87 
 
 
409 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514421  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3553  aluminum resistance family protein  51.88 
 
 
409 aa  439  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.916774  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0641  Aluminium resistance family protein  52.79 
 
 
407 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1438  aluminium resistance  51.77 
 
 
416 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.406452  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0663  Aluminium resistance family protein  52.79 
 
 
407 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4811  Aluminium resistance family protein  52.7 
 
 
432 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.851244  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1496  Aluminium resistance family protein  50.75 
 
 
426 aa  428  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000675206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3348  Aluminium resistance family protein  49.14 
 
 
410 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1175  aluminum resistance protein  50.73 
 
 
426 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.446504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1362  aluminum resistance protein  50.24 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00883878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1005  putative aluminum resistance protein  50.13 
 
 
411 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000549762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1571  Aluminium resistance family protein  52.87 
 
 
422 aa  415  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2540  hypothetical protein  50.25 
 
 
430 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2190  hypothetical protein  51.14 
 
 
448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28921  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  51.91 
 
 
433 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0951  Aluminium resistance family protein  47.81 
 
 
425 aa  395  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17971  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  49.87 
 
 
433 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1119  aluminium resistance  51.67 
 
 
431 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.165119  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21401  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  45.79 
 
 
421 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1269  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  45.54 
 
 
421 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1882  cystathionine beta-lyase family protein  43.28 
 
 
422 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000688735 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1503  Aluminium resistance family protein  46.96 
 
 
427 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000404757 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18601  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  43.88 
 
 
430 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18601  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  43.54 
 
 
430 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1762  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  44.22 
 
 
430 aa  355  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18791  cystathionine beta-lyase family aluminum resistance protein  43.95 
 
 
430 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1004  cystathionine gamma-synthase  31.94 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  hitchhiker  0.000527266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  29.58 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  29.58 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  29.36 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  28.9 
 
 
398 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  31.53 
 
 
391 aa  59.7  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43850  Cystathionine gamma-synthase  33.15 
 
 
396 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0357  hypothetical protein  27.59 
 
 
364 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  25.87 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  27.42 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  32.5 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0179  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  28.31 
 
 
363 aa  53.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4014  cystathionine gamma-synthase  26.21 
 
 
400 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  30.18 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  29.8 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  30.22 
 
 
383 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6599  hypothetical protein  27 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  26.29 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  26 
 
 
392 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  26 
 
 
392 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  26 
 
 
392 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  28.28 
 
 
395 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  26.46 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0481  O-acetylhomoserineaminocarboxypropyltransferase  25.45 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  28.57 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  26.15 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  24.63 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  28.18 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2131  cystathionine gamma-synthase  25.1 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.594971  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  26.04 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  27.06 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4838  cystathionine gamma-synthase  24.58 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.370286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0098  cystathionine gamma-synthase  28.19 
 
 
403 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  27.35 
 
 
378 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3162  L-allo-threonine aldolase  26.02 
 
 
348 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  22.16 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  25.93 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4283  cystathionine gamma-synthase  24.63 
 
 
389 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940043  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  27.08 
 
 
404 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  29.3 
 
 
896 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  26.8 
 
 
386 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  27.08 
 
 
404 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5616  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  27.27 
 
 
475 aa  47  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.451549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  26.11 
 
 
386 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  28.92 
 
 
406 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  27.51 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  24.44 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6437  hypothetical protein  26.2 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.316808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>