32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1627 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1627  CRISPR-associated Csm1 family protein  100 
 
 		 780 aa  1607    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0744  CRISPR-associated Csm1 family protein  28.71 
 
 		 845 aa  265  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1637  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.59 
 
 		 800 aa  264  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.02785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1349  CRISPR-associated Csm1 family protein  28.07 
 
 		 848 aa  263  8.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0215  Csm1 family CRISPR-associated protein  25.67 
 
 		 806 aa  240  6.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0699  CRISPR-associated protein, Csm1 family  24.97 
 
 		 808 aa  239  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424994  decreased coverage  0.00221335 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1028  CRISPR-associated protein, Csm1 family  28.73 
 
 		 755 aa  225  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00145134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2461  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.4 
 
 		 757 aa  206  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0456597  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1670  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 		 757 aa  201  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2704  metal dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 		 837 aa  194  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1083  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.16 
 
 		 838 aa  192  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12837  hypothetical protein  27.8 
 
 		 812 aa  191  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.867182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1388  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 		 830 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1756  CRISPR-associated Csm1 family protein  25.07 
 
 		 808 aa  185  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1250  CRISPR-associated protein, Csm1 family  26.36 
 
 		 850 aa  181  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2475  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.55 
 
 		 731 aa  161  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0612  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 799 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.52 
 
 		 717 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 		 735 aa  148  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2826  CRISPR-associated protein, Csm1 family  24.11 
 
 		 737 aa  147  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3443  CRISPR-associated protein, Csm1 family  29.41 
 
 		 719 aa  85.1  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.791619 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3256  CRISPR-associated protein, Csm1 family  28.79 
 
 		 810 aa  82  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1977  CRISPR-associated Csm1 family protein  26.5 
 
 		 750 aa  77.8  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.757339  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2454  CRISPR-associated protein, Csm1 family  34.06 
 
 		 761 aa  74.7  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.442356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2050  CRISPR-associated Csm1 family protein  23.79 
 
 		 762 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2055  hypothetical protein  25.88 
 
 		 639 aa  52.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  23 
 
 		 488 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0118  CRISPR-associated Csm1 family protein  45.1 
 
 		 55 aa  48.5  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1438  hypothetical protein  27.16 
 
 		 547 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014428 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  23.44 
 
 		 494 aa  47  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2979  CRISPR-associated protein, Crm2 family  31.62 
 
 		 623 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113889 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0316  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.63 
 
 		 548 aa  45.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.182847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>