More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0765 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 123 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  81.82 
 
 		 124 aa  210  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  80 
 
 		 125 aa  209  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  79.17 
 
 		 124 aa  197  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  76.86 
 
 		 127 aa  196  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  73.17 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  73.17 
 
 		 153 aa  186  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  70.49 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  68.85 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  69.92 
 
 		 145 aa  183  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  68.91 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  67.5 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  67.48 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  63.41 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  63.41 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  67.48 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  69.42 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  66.94 
 
 		 129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  63.64 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  64.52 
 
 		 146 aa  173  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  69.75 
 
 		 137 aa  173  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  65.29 
 
 		 137 aa  172  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  67.52 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  70.73 
 
 		 125 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  64.96 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  64.75 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  57.38 
 
 		 154 aa  157  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  62.4 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  58.33 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  56 
 
 		 143 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  56 
 
 		 143 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.1 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  57.6 
 
 		 127 aa  147  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.56 
 
 		 128 aa  146  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  56.8 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  57.26 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.26 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  57.26 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  57.26 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  56.45 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  57.26 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  56 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  55.65 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  55.56 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  57.26 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  55.65 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  57.26 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.65 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  54.76 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  53.54 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  57.26 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  55.56 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  56 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  55.65 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  56 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  60.16 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  56 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  54.33 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  55.2 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  55.65 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  56.45 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  56.45 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.84 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  55.65 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  56.45 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  56.45 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  56.45 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  55.65 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  54.4 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2423  scaffold protein  56.45 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  53.97 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  55.2 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  54.84 
 
 		 135 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.6 
 
 		 135 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1489  scaffold protein  55.2 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  55.65 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  55.2 
 
 		 138 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  56.45 
 
 		 125 aa  143  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  52.14 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  54.84 
 
 		 135 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  54.84 
 
 		 135 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  53.97 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  54.84 
 
 		 135 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  53.23 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  53.97 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  54.84 
 
 		 135 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  54.84 
 
 		 135 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  55.2 
 
 		 128 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  54.84 
 
 		 135 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  55.56 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  54.84 
 
 		 135 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1239  scaffold protein  56 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  54.84 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>